RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.51□□□□□ -1.53
CCSAP-204ENST00000483092 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CCSAP-204ENST00000483092 MT1EP04732 61 aa5.45□□□□□ -1.54
CCSAP-204ENST00000483092 MT1LQ93083 61 aa5.44□□□□□ -1.54
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP12-4P60329 112 aa5.42□□□□□ -1.54
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.41□□□□□ -1.54
CCSAP-204ENST00000483092 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CCSAP-204ENST00000483092 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.36□□□□□ -1.55
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.35□□□□□ -1.55
CCSAP-204ENST00000483092 MT1GP13640 62 aa5.28□□□□□ -1.56
CCSAP-204ENST00000483092 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CCSAP-204ENST00000483092 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
CCSAP-204ENST00000483092 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CCSAP-204ENST00000483092 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.19□□□□□ -1.58
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.12□□□□□ -1.59
CCSAP-204ENST00000483092 MT1MQ8N339 61 aa5.12□□□□□ -1.59
CCSAP-204ENST00000483092 LCE3BQ5TA77 95 aa5.11□□□□□ -1.59
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.1□□□□□ -1.59
CCSAP-204ENST00000483092 MDN1Q9NU22 5596 aa5.04□□□□□ -1.6
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.99□□□□□ -1.61
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.99□□□□□ -1.61
CCSAP-204ENST00000483092 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.9□□□□□ -1.62
CCSAP-204ENST00000483092 PRM1P04553 51 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.82□□□□□ -1.64
CCSAP-204ENST00000483092 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.78□□□□□ -1.64
CCSAP-204ENST00000483092 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.73□□□□□ -1.65
CCSAP-204ENST00000483092 SPRR2EP22531 72 aa4.7□□□□□ -1.66
CCSAP-204ENST00000483092 SPRR2BP35325 72 aa4.7□□□□□ -1.66
CCSAP-204ENST00000483092 SPRR2AP35326 72 aa4.7□□□□□ -1.66
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.7□□□□□ -1.66
CCSAP-204ENST00000483092 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.67□□□□□ -1.66
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CCSAP-204ENST00000483092 MT1AP04731 61 aa4.51□□□□□ -1.69
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP5-9P26371 169 aa4.5□□□□□ -1.69
CCSAP-204ENST00000483092 SPRR2DP22532 72 aa4.48□□□□□ -1.69
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.46□□□□□ -1.7
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.41□□□□□ -1.7
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.34□□□□□ -1.72
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.26□□□□□ -1.73
CCSAP-204ENST00000483092 LCE1EQ5T753 118 aa4.2□□□□□ -1.74
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.19□□□□□ -1.74
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.13□□□□□ -1.75
CCSAP-204ENST00000483092 MT4P47944 62 aa4.11□□□□□ -1.75
CCSAP-204ENST00000483092 MT3P25713 68 aa4.11□□□□□ -1.75
CCSAP-204ENST00000483092 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.05□□□□□ -1.76
CCSAP-204ENST00000483092 NEBP20929 6669 aa4.03□□□□□ -1.76
CCSAP-204ENST00000483092 LCE1DQ5T752 114 aa3.95□□□□□ -1.78
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.84□□□□□ -1.8
CCSAP-204ENST00000483092 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.83□□□□□ -1.8
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.77□□□□□ -1.81
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.71□□□□□ -1.82
CCSAP-204ENST00000483092 LCE4AQ5TA78 99 aa3.65□□□□□ -1.82
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-204ENST00000483092 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.6□□□□□ -1.83
CCSAP-204ENST00000483092 MUC5ACP98088 5654 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-204ENST00000483092 LCE1FQ5T754 118 aa3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-204ENST00000483092 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.17□□□□□ -1.9
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-204ENST00000483092 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.07□□□□□ -1.92
CCSAP-204ENST00000483092 LCE1CQ5T751 118 aa3.06□□□□□ -1.92
CCSAP-204ENST00000483092 GPR98Q8WXG9 6306 aa3□□□□□ -1.93
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP5-8O75690 187 aa2.96□□□□□ -1.93
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.94□□□□□ -1.94
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.68□□□□□ -1.98
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.62□□□□□ -1.99
CCSAP-204ENST00000483092 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-204ENST00000483092 PHGR1C9JFL3 82 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-204ENST00000483092 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.4 ms