RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRF-212ENST00000477970 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRF-212ENST00000477970 MT1EP04732 61 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRF-212ENST00000477970 KMT2DO14686 5537 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRF-212ENST00000477970 MT1LQ93083 61 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRF-212ENST00000477970 NEBP20929 6669 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRF-212ENST00000477970 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRF-212ENST00000477970 INE1O15225 51 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRF-212ENST00000477970 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRF-212ENST00000477970 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRF-212ENST00000477970 SPRR2EP22531 72 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRF-212ENST00000477970 SPRR2BP35325 72 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRF-212ENST00000477970 SPRR2AP35326 72 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRF-212ENST00000477970 MT1GP13640 62 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRF-212ENST00000477970 MDN1Q9NU22 5596 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRF-212ENST00000477970 MT1MQ8N339 61 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRF-212ENST00000477970 SPRR2DP22532 72 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRF-212ENST00000477970 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRF-212ENST00000477970 LCE3BQ5TA77 95 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRF-212ENST00000477970 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRF-212ENST00000477970 MT1AP04731 61 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRF-212ENST00000477970 LCE4AQ5TA78 99 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRF-212ENST00000477970 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRF-212ENST00000477970 LCE1EQ5T753 118 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRF-212ENST00000477970 LCE1FQ5T754 118 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRF-212ENST00000477970 LCE1DQ5T752 114 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP12-4P60329 112 aa3.49□□□□□ -1.85
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PTPRF-212ENST00000477970 MT4P47944 62 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRF-212ENST00000477970 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.38□□□□□ -1.87
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PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRF-212ENST00000477970 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRF-212ENST00000477970 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRF-212ENST00000477970 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRF-212ENST00000477970 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRF-212ENST00000477970 MT3P25713 68 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRF-212ENST00000477970 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRF-212ENST00000477970 PRM1P04553 51 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRF-212ENST00000477970 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3□□□□□ -1.93
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP5-8O75690 187 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRF-212ENST00000477970 MUC5ACP98088 5654 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRF-212ENST00000477970 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRF-212ENST00000477970 LCE1CQ5T751 118 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRF-212ENST00000477970 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRF-212ENST00000477970 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.58□□□□□ -2
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRF-212ENST00000477970 PHGR1C9JFL3 82 aa1.98□□□□□ -2.09
PTPRF-212ENST00000477970 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.33□□□□□ -2.2
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