RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473244.5

MED15-222, Transcript of mediator complex subunit 15, human

TSL 1 (best)

Gene MED15, Length 2,733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED15-222	ENST00000473244	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		6.43	□□□□□ -1.38
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6.38	□□□□□ -1.39
MED15-222	ENST00000473244	MT1G	P13640	62 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MED15-222	ENST00000473244	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MED15-222	ENST00000473244	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
MED15-222	ENST00000473244	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP12-4	P60329	112 aa		6.18	□□□□□ -1.42
MED15-222	ENST00000473244	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		6.16	□□□□□ -1.42
MED15-222	ENST00000473244	MT1M	Q8N339	61 aa		6.15	□□□□□ -1.42
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		6.08	□□□□□ -1.44
MED15-222	ENST00000473244	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MED15-222	ENST00000473244	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MED15-222	ENST00000473244	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
MED15-222	ENST00000473244	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MED15-222	ENST00000473244	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MED15-222	ENST00000473244	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MED15-222	ENST00000473244	MT1A	P04731	61 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MED15-222	ENST00000473244	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.62	□□□□□ -1.51
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
MED15-222	ENST00000473244	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		5.61	□□□□□ -1.51
MED15-222	ENST00000473244	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MED15-222	ENST00000473244	PRM1	P04553	51 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
MED15-222	ENST00000473244	MDN1	Q9NU22	5596 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED15-222	ENST00000473244	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MED15-222	ENST00000473244	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP5-9	P26371	169 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MED15-222	ENST00000473244	SPRR2E	P22531	72 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MED15-222	ENST00000473244	SPRR2B	P35325	72 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MED15-222	ENST00000473244	SPRR2A	P35326	72 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MED15-222	ENST00000473244	NEB	P20929	6669 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED15-222	ENST00000473244	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MED15-222	ENST00000473244	MT3	P25713	68 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED15-222	ENST00000473244	SPRR2D	P22532	72 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED15-222	ENST00000473244	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.43	□□□□□ -1.7
MED15-222	ENST00000473244	MT4	P47944	62 aa		4.38	□□□□□ -1.71
MED15-222	ENST00000473244	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MED15-222	ENST00000473244	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MED15-222	ENST00000473244	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.32	□□□□□ -1.72
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.31	□□□□□ -1.72
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.27	□□□□□ -1.73
MED15-222	ENST00000473244	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MED15-222	ENST00000473244	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MED15-222	ENST00000473244	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.84	□□□□□ -1.8
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED15-222	ENST00000473244	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MED15-222	ENST00000473244	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MED15-222	ENST00000473244	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		3.5	□□□□□ -1.85
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.47	□□□□□ -1.85
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MED15-222	ENST00000473244	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.27	□□□□□ -1.89
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MED15-222	ENST00000473244	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MED15-222	ENST00000473244	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
MED15-222	ENST00000473244	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MED15-222	ENST00000473244	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.94	□□□□□ -2.1

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