RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.58□□□□□ -1.68
SH3BP1-206ENST00000469947 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.58□□□□□ -1.68
SH3BP1-206ENST00000469947 MT1LQ93083 61 aa4.56□□□□□ -1.68
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.55□□□□□ -1.68
SH3BP1-206ENST00000469947 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1-206ENST00000469947 MT1EP04732 61 aa4.51□□□□□ -1.69
SH3BP1-206ENST00000469947 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1-206ENST00000469947 MT1GP13640 62 aa4.39□□□□□ -1.71
SH3BP1-206ENST00000469947 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1-206ENST00000469947 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP12-4P60329 112 aa4.32□□□□□ -1.72
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1-206ENST00000469947 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
SH3BP1-206ENST00000469947 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1-206ENST00000469947 MT1MQ8N339 61 aa4.21□□□□□ -1.74
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.17□□□□□ -1.74
SH3BP1-206ENST00000469947 LCE3BQ5TA77 95 aa4.15□□□□□ -1.74
SH3BP1-206ENST00000469947 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.15□□□□□ -1.74
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1-206ENST00000469947 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1-206ENST00000469947 MDN1Q9NU22 5596 aa4.11□□□□□ -1.75
SH3BP1-206ENST00000469947 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
SH3BP1-206ENST00000469947 MT1AP04731 61 aa3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP5-9P26371 169 aa3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1-206ENST00000469947 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.95□□□□□ -1.78
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.93□□□□□ -1.78
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1-206ENST00000469947 LCE1FQ5T754 118 aa3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1-206ENST00000469947 PRM1P04553 51 aa3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1-206ENST00000469947 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1-206ENST00000469947 SPRR2EP22531 72 aa3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1-206ENST00000469947 SPRR2BP35325 72 aa3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1-206ENST00000469947 SPRR2AP35326 72 aa3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1-206ENST00000469947 LCE1EQ5T753 118 aa3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1-206ENST00000469947 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1-206ENST00000469947 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1-206ENST00000469947 SPRR2DP22532 72 aa3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1-206ENST00000469947 NEBP20929 6669 aa3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1-206ENST00000469947 LCE1DQ5T752 114 aa3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.67□□□□□ -1.82
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1-206ENST00000469947 MT3P25713 68 aa3.53□□□□□ -1.84
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.52□□□□□ -1.85
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.33□□□□□ -1.88
SH3BP1-206ENST00000469947 MT4P47944 62 aa3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1-206ENST00000469947 LCE4AQ5TA78 99 aa3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1-206ENST00000469947 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.24□□□□□ -1.89
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.15□□□□□ -1.9
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.12□□□□□ -1.91
SH3BP1-206ENST00000469947 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.05□□□□□ -1.92
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.05□□□□□ -1.92
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.02□□□□□ -1.93
SH3BP1-206ENST00000469947 MUC5ACP98088 5654 aa3.01□□□□□ -1.93
SH3BP1-206ENST00000469947 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
SH3BP1-206ENST00000469947 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.95□□□□□ -1.94
SH3BP1-206ENST00000469947 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.83□□□□□ -1.96
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.74□□□□□ -1.97
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP5-8O75690 187 aa2.6□□□□□ -1.99
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.58□□□□□ -2
SH3BP1-206ENST00000469947 LCE1CQ5T751 118 aa2.53□□□□□ -2
SH3BP1-206ENST00000469947 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.5□□□□□ -2.01
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.48□□□□□ -2.01
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.48□□□□□ -2.01
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.45□□□□□ -2.02
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.31□□□□□ -2.04
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.21□□□□□ -2.05
SH3BP1-206ENST00000469947 PHGR1C9JFL3 82 aa1.93□□□□□ -2.1
SH3BP1-206ENST00000469947 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.33□□□□□ -2.2
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