RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4-208ENST00000462602 PRAC1Q96KF2 57 aa3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4-208ENST00000462602 NEBP20929 6669 aa3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4-208ENST00000462602 MT1LQ93083 61 aa3.36□□□□□ -1.87
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.35□□□□□ -1.87
SH3BP4-208ENST00000462602 MDN1Q9NU22 5596 aa3.35□□□□□ -1.87
SH3BP4-208ENST00000462602 MT1GP13640 62 aa3.34□□□□□ -1.87
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.33□□□□□ -1.88
SH3BP4-208ENST00000462602 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.33□□□□□ -1.88
SH3BP4-208ENST00000462602 SVIPQ8NHG7 77 aa3.33□□□□□ -1.88
SH3BP4-208ENST00000462602 SPRR2DP22532 72 aa3.29□□□□□ -1.88
SH3BP4-208ENST00000462602 MT1MQ8N339 61 aa3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4-208ENST00000462602 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.19□□□□□ -1.9
SH3BP4-208ENST00000462602 LCE3BQ5TA77 95 aa3.18□□□□□ -1.9
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.18□□□□□ -1.9
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.15□□□□□ -1.91
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.12□□□□□ -1.91
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.12□□□□□ -1.91
SH3BP4-208ENST00000462602 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4-208ENST00000462602 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3□□□□□ -1.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3□□□□□ -1.93
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4-208ENST00000462602 LCE4AQ5TA78 99 aa2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4-208ENST00000462602 MT1AP04731 61 aa2.87□□□□□ -1.95
SH3BP4-208ENST00000462602 LUZP6Q538Z0 58 aa2.86□□□□□ -1.95
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4-208ENST00000462602 MT4P47944 62 aa2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP12-4P60329 112 aa2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4-208ENST00000462602 LCE1DQ5T752 114 aa2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4-208ENST00000462602 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4-208ENST00000462602 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4-208ENST00000462602 MT3P25713 68 aa2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4-208ENST00000462602 NDUFAF8A1L188 74 aa2.58□□□□□ -2
SH3BP4-208ENST00000462602 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4-208ENST00000462602 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4-208ENST00000462602 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0A0MQY5 61 aa2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP5-8O75690 187 aa2.33□□□□□ -2.04
SH3BP4-208ENST00000462602 LCE1EQ5T753 118 aa2.33□□□□□ -2.04
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.33□□□□□ -2.04
SH3BP4-208ENST00000462602 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4-208ENST00000462602 H3BS24 57 aa2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4-208ENST00000462602 MUC5ACP98088 5654 aa2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.18□□□□□ -2.06
SH3BP4-208ENST00000462602 INE1O15225 51 aa2.17□□□□□ -2.06
SH3BP4-208ENST00000462602 LCE1CQ5T751 118 aa2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4-208ENST00000462602 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.14□□□□□ -2.07
SH3BP4-208ENST00000462602 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
SH3BP4-208ENST00000462602 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4-208ENST00000462602 PRM1P04553 51 aa1.9□□□□□ -2.11
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.84□□□□□ -2.11
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa1.82□□□□□ -2.12
SH3BP4-208ENST00000462602 LCE1FQ5T754 118 aa1.81□□□□□ -2.12
SH3BP4-208ENST00000462602 PHGR1C9JFL3 82 aa1.64□□□□□ -2.15
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.63□□□□□ -2.15
SH3BP4-208ENST00000462602 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.4□□□□□ -2.19
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.12□□□□□ -2.23
SH3BP4-208ENST00000462602 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.02□□□□□ -2.25
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