RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 MDN1Q9NU22 5596 aa8.68□□□□□ -1.02
NME4-209ENST00000460297 MT1LQ93083 61 aa8.66□□□□□ -1.02
NME4-209ENST00000460297 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.62□□□□□ -1.03
NME4-209ENST00000460297 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa8.6□□□□□ -1.03
NME4-209ENST00000460297 SPRR2EP22531 72 aa8.56□□□□□ -1.04
NME4-209ENST00000460297 SPRR2BP35325 72 aa8.56□□□□□ -1.04
NME4-209ENST00000460297 SPRR2AP35326 72 aa8.56□□□□□ -1.04
NME4-209ENST00000460297 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.5□□□□□ -1.05
NME4-209ENST00000460297 MT1GP13640 62 aa8.49□□□□□ -1.05
NME4-209ENST00000460297 NEBP20929 6669 aa8.42□□□□□ -1.06
NME4-209ENST00000460297 MT1MQ8N339 61 aa8.39□□□□□ -1.07
NME4-209ENST00000460297 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.38□□□□□ -1.07
NME4-209ENST00000460297 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.37□□□□□ -1.07
NME4-209ENST00000460297 LCE3CQ5T5A8 94 aa8.35□□□□□ -1.07
NME4-209ENST00000460297 SPRR2DP22532 72 aa8.26□□□□□ -1.09
NME4-209ENST00000460297 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.24□□□□□ -1.09
NME4-209ENST00000460297 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
NME4-209ENST00000460297 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa8.01□□□□□ -1.13
NME4-209ENST00000460297 LCE3BQ5TA77 95 aa7.96□□□□□ -1.13
NME4-209ENST00000460297 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.93□□□□□ -1.14
NME4-209ENST00000460297 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.87□□□□□ -1.15
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NME4-209ENST00000460297 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.87□□□□□ -1.15
NME4-209ENST00000460297 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.82□□□□□ -1.16
NME4-209ENST00000460297 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.69□□□□□ -1.18
NME4-209ENST00000460297 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.69□□□□□ -1.18
NME4-209ENST00000460297 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
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NME4-209ENST00000460297 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.42□□□□□ -1.22
NME4-209ENST00000460297 MT1AP04731 61 aa7.35□□□□□ -1.23
NME4-209ENST00000460297 LCE4AQ5TA78 99 aa7.32□□□□□ -1.24
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NME4-209ENST00000460297 H3BS24 57 aa7.29□□□□□ -1.24
NME4-209ENST00000460297 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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NME4-209ENST00000460297 MT3P25713 68 aa6.66□□□□□ -1.34
NME4-209ENST00000460297 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.37□□□□□ -1.39
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NME4-209ENST00000460297 A0A0A0MQY5 61 aa6.21□□□□□ -1.42
NME4-209ENST00000460297 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.21□□□□□ -1.42
NME4-209ENST00000460297 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.11□□□□□ -1.43
NME4-209ENST00000460297 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.1□□□□□ -1.43
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NME4-209ENST00000460297 KRTAP5-8O75690 187 aa5.89□□□□□ -1.47
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NME4-209ENST00000460297 INE1O15225 51 aa5.81□□□□□ -1.48
NME4-209ENST00000460297 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.7□□□□□ -1.5
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NME4-209ENST00000460297 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.52□□□□□ -1.53
NME4-209ENST00000460297 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.51□□□□□ -1.53
NME4-209ENST00000460297 LCE1CQ5T751 118 aa5.47□□□□□ -1.53
NME4-209ENST00000460297 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.35□□□□□ -1.55
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NME4-209ENST00000460297 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
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NME4-209ENST00000460297 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.61
NME4-209ENST00000460297 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.86□□□□□ -1.63
NME4-209ENST00000460297 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.8□□□□□ -1.64
NME4-209ENST00000460297 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.67□□□□□ -1.66
NME4-209ENST00000460297 LCE1FQ5T754 118 aa4.45□□□□□ -1.7
NME4-209ENST00000460297 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.29□□□□□ -1.72
NME4-209ENST00000460297 PHGR1C9JFL3 82 aa4.19□□□□□ -1.74
NME4-209ENST00000460297 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.81□□□□□ -1.8
NME4-209ENST00000460297 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.04□□□□□ -1.92
NME4-209ENST00000460297 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.69□□□□□ -1.98
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