RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 SPRR2EP22531 72 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1-205ENST00000450873 SPRR2BP35325 72 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1-205ENST00000450873 SPRR2AP35326 72 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP10-12P60413 245 aa4.21□□□□□ -1.73
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1-205ENST00000450873 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1-205ENST00000450873 INE1O15225 51 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-205ENST00000450873 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SPRR2DP22532 72 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.09□□□□□ -1.75
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RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.96□□□□□ -1.78
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RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.92□□□□□ -1.78
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RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.84□□□□□ -1.79
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RABGEF1-205ENST00000450873 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGEF1-205ENST00000450873 MT1GP13640 62 aa3.78□□□□□ -1.8
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RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1-205ENST00000450873 MT1MQ8N339 61 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGEF1-205ENST00000450873 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.66□□□□□ -1.82
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RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MT4P47944 62 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1-205ENST00000450873 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGEF1-205ENST00000450873 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGEF1-205ENST00000450873 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.37□□□□□ -1.87
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP12-4P60329 112 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1-205ENST00000450873 MT1AP04731 61 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.18□□□□□ -1.9
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RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP5-8O75690 187 aa2.98□□□□□ -1.93
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RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGEF1-205ENST00000450873 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGEF1-205ENST00000450873 PRM1P04553 51 aa2.68□□□□□ -1.98
RABGEF1-205ENST00000450873 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.66□□□□□ -1.98
RABGEF1-205ENST00000450873 LCE1EQ5T753 118 aa2.66□□□□□ -1.98
RABGEF1-205ENST00000450873 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGEF1-205ENST00000450873 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGEF1-205ENST00000450873 LCE1CQ5T751 118 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGEF1-205ENST00000450873 LCE1FQ5T754 118 aa2.4□□□□□ -2.02
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGEF1-205ENST00000450873 PHGR1C9JFL3 82 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.8□□□□□ -2.12
RABGEF1-205ENST00000450873 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.7□□□□□ -2.14
RABGEF1-205ENST00000450873 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.28□□□□□ -2.2
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