RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442447.5

RBM39-215, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 644 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-215ENST00000442447 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-215ENST00000442447 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-215ENST00000442447 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-215ENST00000442447 TNP1P09430 55 aa5.85□□□□□ -1.47
RBM39-215ENST00000442447 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RBM39-215ENST00000442447 A6NED7 52 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-215ENST00000442447 LCE3AQ5TA76 89 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-215ENST00000442447 MT1GP13640 62 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-215ENST00000442447 PP632Q6XCG6 107 aa5.77□□□□□ -1.49
RBM39-215ENST00000442447 MT1LQ93083 61 aa5.77□□□□□ -1.49
RBM39-215ENST00000442447 MT1MQ8N339 61 aa5.74□□□□□ -1.49
RBM39-215ENST00000442447 K7ERS5 55 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-215ENST00000442447 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP12-3P60328 96 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-215ENST00000442447 LCE1DQ5T752 114 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-215ENST00000442447 LCE4AQ5TA78 99 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-215ENST00000442447 MT4P47944 62 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-215ENST00000442447 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.45□□□□□ -1.54
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.44□□□□□ -1.54
RBM39-215ENST00000442447 BRK1Q8WUW1 75 aa5.43□□□□□ -1.54
RBM39-215ENST00000442447 ROMO1P60602 79 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.34□□□□□ -1.55
RBM39-215ENST00000442447 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.27□□□□□ -1.57
RBM39-215ENST00000442447 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.26□□□□□ -1.57
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.2□□□□□ -1.58
RBM39-215ENST00000442447 PRAC1Q96KF2 57 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-215ENST00000442447 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP12-4P60329 112 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-215ENST00000442447 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-215ENST00000442447 PMAIP1Q13794 54 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-215ENST00000442447 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-215ENST00000442447 PRO0628Q9UI54 55 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.91□□□□□ -1.62
RBM39-215ENST00000442447 MT1AP04731 61 aa4.9□□□□□ -1.63
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.89□□□□□ -1.63
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.88□□□□□ -1.63
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.78□□□□□ -1.64
RBM39-215ENST00000442447 NDUFAF8A1L188 74 aa4.71□□□□□ -1.66
RBM39-215ENST00000442447 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.71□□□□□ -1.66
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP5-8O75690 187 aa4.52□□□□□ -1.69
RBM39-215ENST00000442447 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RBM39-215ENST00000442447 MT3P25713 68 aa4.48□□□□□ -1.69
RBM39-215ENST00000442447 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.44□□□□□ -1.7
RBM39-215ENST00000442447 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RBM39-215ENST00000442447 MUC5ACP98088 5654 aa4.28□□□□□ -1.72
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.28□□□□□ -1.72
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.13□□□□□ -1.75
RBM39-215ENST00000442447 LCE1EQ5T753 118 aa4.09□□□□□ -1.75
RBM39-215ENST00000442447 LUZP6Q538Z0 58 aa3.97□□□□□ -1.77
RBM39-215ENST00000442447 LCE1FQ5T754 118 aa3.96□□□□□ -1.78
RBM39-215ENST00000442447 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-215ENST00000442447 LCE1CQ5T751 118 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-215ENST00000442447 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.72□□□□□ -1.81
RBM39-215ENST00000442447 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.5□□□□□ -1.85
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-215ENST00000442447 PHGR1C9JFL3 82 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-215ENST00000442447 INE1O15225 51 aa2.96□□□□□ -1.94
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.96□□□□□ -1.94
RBM39-215ENST00000442447 PRM1P04553 51 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-215ENST00000442447 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.73□□□□□ -1.97
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.26□□□□□ -2.05
RBM39-215ENST00000442447 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.96□□□□□ -2.1
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