RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGEF1-203ENST00000439720 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.09□□□□□ -1.91
RABGEF1-203ENST00000439720 USH2AO75445 5202 aa3.09□□□□□ -1.91
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP5-9P26371 169 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1-203ENST00000439720 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGEF1-203ENST00000439720 NEBP20929 6669 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.01□□□□□ -1.93
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3□□□□□ -1.93
RABGEF1-203ENST00000439720 LCE1DQ5T752 114 aa3□□□□□ -1.93
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGEF1-203ENST00000439720 KMT2DO14686 5537 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.9□□□□□ -1.94
RABGEF1-203ENST00000439720 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa2.85□□□□□ -1.95
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.84□□□□□ -1.96
RABGEF1-203ENST00000439720 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.81□□□□□ -1.96
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RABGEF1-203ENST00000439720 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.78□□□□□ -1.96
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RABGEF1-203ENST00000439720 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGEF1-203ENST00000439720 MT1LQ93083 61 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RABGEF1-203ENST00000439720 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.7□□□□□ -1.98
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RABGEF1-203ENST00000439720 SPRR2EP22531 72 aa2.69□□□□□ -1.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SPRR2BP35325 72 aa2.69□□□□□ -1.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SPRR2AP35326 72 aa2.69□□□□□ -1.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MT3P25713 68 aa2.67□□□□□ -1.98
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGEF1-203ENST00000439720 MT1GP13640 62 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGEF1-203ENST00000439720 SPRR2DP22532 72 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGEF1-203ENST00000439720 LCE3BQ5TA77 95 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.59□□□□□ -2
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.56□□□□□ -2
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.56□□□□□ -2
RABGEF1-203ENST00000439720 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RABGEF1-203ENST00000439720 MT1MQ8N339 61 aa2.54□□□□□ -2
RABGEF1-203ENST00000439720 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.54□□□□□ -2
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.54□□□□□ -2
RABGEF1-203ENST00000439720 PRM1P04553 51 aa2.53□□□□□ -2.01
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGEF1-203ENST00000439720 MDN1Q9NU22 5596 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGEF1-203ENST00000439720 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGEF1-203ENST00000439720 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
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RABGEF1-203ENST00000439720 MT1AP04731 61 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGEF1-203ENST00000439720 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGEF1-203ENST00000439720 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.3□□□□□ -2.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.21□□□□□ -2.05
RABGEF1-203ENST00000439720 MT4P47944 62 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGEF1-203ENST00000439720 LCE1CQ5T751 118 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGEF1-203ENST00000439720 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP5-8O75690 187 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RABGEF1-203ENST00000439720 MUC5ACP98088 5654 aa1.99□□□□□ -2.09
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.58□□□□□ -2.16
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGEF1-203ENST00000439720 PHGR1C9JFL3 82 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGEF1-203ENST00000439720 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.97□□□□□ -2.25
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