RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 A8MUU9 505 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRK-211ENST00000429595 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRK-211ENST00000429595 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRK-211ENST00000429595 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-211ENST00000429595 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-211ENST00000429595 A6NN06 94 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1B0GU69 56 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-211ENST00000429595 UQCR11O14957 56 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-211ENST00000429595 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-211ENST00000429595 SPINK7P58062 85 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRK-211ENST00000429595 SEC61GP60059 68 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-211ENST00000429595 SPRR2EP22531 72 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRK-211ENST00000429595 SPRR2BP35325 72 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRK-211ENST00000429595 SPRR2AP35326 72 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRK-211ENST00000429595 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRK-211ENST00000429595 MDN1Q9NU22 5596 aa2.96□□□□□ -1.93
PTPRK-211ENST00000429595 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1B0GU33 70 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRK-211ENST00000429595 SPRR2DP22532 72 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRK-211ENST00000429595 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRK-211ENST00000429595 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRK-211ENST00000429595 H0YAA0 97 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRK-211ENST00000429595 K7ERS5 55 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRK-211ENST00000429595 S4R3F8 94 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-211ENST00000429595 LINC01554Q52M75 96 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-211ENST00000429595 M0QZ58 72 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRK-211ENST00000429595 CSAG1Q6PB30 78 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRK-211ENST00000429595 ROMO1P60602 79 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-211ENST00000429595 ADM2Q7Z4H4 148 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRK-211ENST00000429595 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-211ENST00000429595 MT1BP07438 61 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-211ENST00000429595 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-211ENST00000429595 P0C880 135 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP12-1P59990 96 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-211ENST00000429595 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-211ENST00000429595 CRIPTQ9P021 101 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0D9SG42 100 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRK-211ENST00000429595 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRK-211ENST00000429595 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRK-211ENST00000429595 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRK-211ENST00000429595 MT4P47944 62 aa2.58□□□□□ -2
PTPRK-211ENST00000429595 R4GN34 69 aa2.58□□□□□ -2
PTPRK-211ENST00000429595 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.57□□□□□ -2
PTPRK-211ENST00000429595 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRK-211ENST00000429595 PLAC4Q8WY50 150 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRK-211ENST00000429595 MT1XP80297 61 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRK-211ENST00000429595 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRK-211ENST00000429595 TNP1P09430 55 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRK-211ENST00000429595 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRK-211ENST00000429595 LUZP6Q538Z0 58 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRK-211ENST00000429595 MUC5ACP98088 5654 aa2.28□□□□□ -2.05
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP12-4P60329 112 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-211ENST00000429595 MT1GP13640 62 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-211ENST00000429595 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
PTPRK-211ENST00000429595 MT1EP04732 61 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP12-3P60328 96 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRK-211ENST00000429595 MT1MQ8N339 61 aa2.14□□□□□ -2.07
PTPRK-211ENST00000429595 INE1O15225 51 aa2.07□□□□□ -2.08
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRK-211ENST00000429595 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.09
PTPRK-211ENST00000429595 MT1LQ93083 61 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.78□□□□□ -2.12
PTPRK-211ENST00000429595 MT1AP04731 61 aa1.73□□□□□ -2.13
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa1.72□□□□□ -2.13
PTPRK-211ENST00000429595 PHGR1C9JFL3 82 aa1.64□□□□□ -2.15
PTPRK-211ENST00000429595 PRM1P04553 51 aa1.39□□□□□ -2.19
PTPRK-211ENST00000429595 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.31□□□□□ -2.2
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 196.4 ms