RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.42□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.41□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MT1AP04731 61 aa4.37□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.34□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LCE1DQ5T752 114 aa4.32□□□□□ -1.72
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.32□□□□□ -1.72
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.31□□□□□ -1.72
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.31□□□□□ -1.72
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.31□□□□□ -1.72
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.19□□□□□ -1.74
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.16□□□□□ -1.74
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.08□□□□□ -1.76
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.08□□□□□ -1.76
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RNF213Q63HN8 5207 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.02□□□□□ -1.77
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.02□□□□□ -1.77
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LCE4AQ5TA78 99 aa4.02□□□□□ -1.77
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4□□□□□ -1.77
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.98□□□□□ -1.77
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.98□□□□□ -1.77
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.97□□□□□ -1.77
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.85□□□□□ -1.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.75□□□□□ -1.81
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LCE1CQ5T751 118 aa3.71□□□□□ -1.82
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LCE1EQ5T753 118 aa3.71□□□□□ -1.82
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LCE1FQ5T754 118 aa3.71□□□□□ -1.82
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MUC2Q02817 5179 aa3.69□□□□□ -1.82
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.62□□□□□ -1.83
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.59□□□□□ -1.84
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP5-9P26371 169 aa3.41□□□□□ -1.86
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.33□□□□□ -1.88
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.26□□□□□ -1.89
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KMT2DO14686 5537 aa3.26□□□□□ -1.89
TTC28-AS1-207ENST00000428584 USH2AO75445 5202 aa3.24□□□□□ -1.89
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NEBP20929 6669 aa3.21□□□□□ -1.9
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.21□□□□□ -1.9
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SSPOA2VEC9 5147 aa3.11□□□□□ -1.91
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.1□□□□□ -1.91
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.93□□□□□ -1.94
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.91□□□□□ -1.94
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.84□□□□□ -1.95
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MDN1Q9NU22 5596 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.73□□□□□ -1.97
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.68□□□□□ -1.98
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MUC5ACP98088 5654 aa2.42□□□□□ -2.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.4□□□□□ -2.03
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.36□□□□□ -2.03
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP5-8O75690 187 aa2.36□□□□□ -2.03
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.34□□□□□ -2.04
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PHGR1C9JFL3 82 aa2.21□□□□□ -2.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.2□□□□□ -2.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.17□□□□□ -2.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.11□□□□□ -2.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2□□□□□ -2.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.95□□□□□ -2.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.92□□□□□ -2.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.28□□□□□ -2.21
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