RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRU-204ENST00000428026 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRU-204ENST00000428026 MUC2Q02817 5179 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRU-204ENST00000428026 MT1EP04732 61 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRU-204ENST00000428026 MT1LQ93083 61 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRU-204ENST00000428026 PRM1P04553 51 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRU-204ENST00000428026 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRU-204ENST00000428026 MT1MQ8N339 61 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRU-204ENST00000428026 MT4P47944 62 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRU-204ENST00000428026 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRU-204ENST00000428026 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRU-204ENST00000428026 MT3P25713 68 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRU-204ENST00000428026 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRU-204ENST00000428026 LCE1DQ5T752 114 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRU-204ENST00000428026 USH2AO75445 5202 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRU-204ENST00000428026 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRU-204ENST00000428026 MT1AP04731 61 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRU-204ENST00000428026 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRU-204ENST00000428026 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4□□□□□ -1.77
PTPRU-204ENST00000428026 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRU-204ENST00000428026 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRU-204ENST00000428026 LCE4AQ5TA78 99 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRU-204ENST00000428026 KMT2DO14686 5537 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRU-204ENST00000428026 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRU-204ENST00000428026 SSPOA2VEC9 5147 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRU-204ENST00000428026 NEBP20929 6669 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRU-204ENST00000428026 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP5-9P26371 169 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRU-204ENST00000428026 LCE1CQ5T751 118 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRU-204ENST00000428026 LCE1EQ5T753 118 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRU-204ENST00000428026 LCE1FQ5T754 118 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRU-204ENST00000428026 MDN1Q9NU22 5596 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRU-204ENST00000428026 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.34□□□□□ -1.88
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PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.15□□□□□ -1.9
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRU-204ENST00000428026 MUC5ACP98088 5654 aa2.9□□□□□ -1.94
PTPRU-204ENST00000428026 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRU-204ENST00000428026 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP5-8O75690 187 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.54□□□□□ -2
PTPRU-204ENST00000428026 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRU-204ENST00000428026 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRU-204ENST00000428026 PHGR1C9JFL3 82 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.07□□□□□ -2.08
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.92□□□□□ -2.1
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.92□□□□□ -2.1
PTPRU-204ENST00000428026 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.35□□□□□ -2.19
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