RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.27□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.26□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.26□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.23□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MT1GP13640 62 aa6.22□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LCE4AQ5TA78 99 aa6.22□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MT1MQ8N339 61 aa6.21□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.2□□□□□ -1.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.2□□□□□ -1.42
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.19□□□□□ -1.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.19□□□□□ -1.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.17□□□□□ -1.42
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.16□□□□□ -1.42
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.1□□□□□ -1.43
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.82□□□□□ -1.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MDN1Q9NU22 5596 aa5.78□□□□□ -1.48
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPRR2BP35325 72 aa5.7□□□□□ -1.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPRR2AP35326 72 aa5.7□□□□□ -1.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.56□□□□□ -1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MT1AP04731 61 aa5.55□□□□□ -1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.53□□□□□ -1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPRR2DP22532 72 aa5.47□□□□□ -1.53
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.35□□□□□ -1.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 MT3P25713 68 aa5.18□□□□□ -1.58
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.07□□□□□ -1.6
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.04□□□□□ -1.6
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 LCE1DQ5T752 114 aa4.92□□□□□ -1.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MT4P47944 62 aa4.79□□□□□ -1.64
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.7□□□□□ -1.66
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.66□□□□□ -1.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.58□□□□□ -1.68
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.52□□□□□ -1.69
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 LCE1EQ5T753 118 aa4.2□□□□□ -1.74
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MUC5ACP98088 5654 aa4.13□□□□□ -1.75
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.98□□□□□ -1.77
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.85□□□□□ -1.79
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.77□□□□□ -1.81
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.75□□□□□ -1.81
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.62□□□□□ -1.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.43□□□□□ -1.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.24□□□□□ -1.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.01□□□□□ -1.93
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHGR1C9JFL3 82 aa2.95□□□□□ -1.94
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.87□□□□□ -1.95
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.93□□□□□ -2.1
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