RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.16□□□□□ -1.9
CCL20-202ENST00000409189 H0YAA0 97 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-202ENST00000409189 CSAG1Q6PB30 78 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-202ENST00000409189 MT2AP02795 61 aa3.12□□□□□ -1.91
CCL20-202ENST00000409189 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.12□□□□□ -1.91
CCL20-202ENST00000409189 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.12□□□□□ -1.91
CCL20-202ENST00000409189 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.11□□□□□ -1.91
CCL20-202ENST00000409189 A0A1B0GU33 70 aa3.11□□□□□ -1.91
CCL20-202ENST00000409189 MT1FP04733 61 aa3.1□□□□□ -1.91
CCL20-202ENST00000409189 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-202ENST00000409189 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-202ENST00000409189 M0QZ58 72 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-202ENST00000409189 P0C880 135 aa3.04□□□□□ -1.92
CCL20-202ENST00000409189 A6NN06 94 aa3.01□□□□□ -1.93
CCL20-202ENST00000409189 K7ERS5 55 aa3.01□□□□□ -1.93
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP10-10P60014 251 aa3.01□□□□□ -1.93
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3□□□□□ -1.93
CCL20-202ENST00000409189 CRIPTQ9P021 101 aa2.99□□□□□ -1.93
CCL20-202ENST00000409189 R4GN34 69 aa2.98□□□□□ -1.93
CCL20-202ENST00000409189 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.95□□□□□ -1.94
CCL20-202ENST00000409189 A0A0D9SG42 100 aa2.94□□□□□ -1.94
CCL20-202ENST00000409189 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.94□□□□□ -1.94
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.94□□□□□ -1.94
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP12-1P59990 96 aa2.92□□□□□ -1.94
CCL20-202ENST00000409189 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.92□□□□□ -1.94
CCL20-202ENST00000409189 LINC01554Q52M75 96 aa2.9□□□□□ -1.95
CCL20-202ENST00000409189 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.88□□□□□ -1.95
CCL20-202ENST00000409189 PP632Q6XCG6 107 aa2.88□□□□□ -1.95
CCL20-202ENST00000409189 ROMO1P60602 79 aa2.87□□□□□ -1.95
CCL20-202ENST00000409189 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.87□□□□□ -1.95
CCL20-202ENST00000409189 SPRR2EP22531 72 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-202ENST00000409189 SPRR2BP35325 72 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-202ENST00000409189 SPRR2AP35326 72 aa2.84□□□□□ -1.95
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CCL20-202ENST00000409189 PLAC4Q8WY50 150 aa2.77□□□□□ -1.97
CCL20-202ENST00000409189 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.77□□□□□ -1.97
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-202ENST00000409189 SPRR2DP22532 72 aa2.74□□□□□ -1.97
CCL20-202ENST00000409189 MT1BP07438 61 aa2.73□□□□□ -1.97
CCL20-202ENST00000409189 LUZP6Q538Z0 58 aa2.73□□□□□ -1.97
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.73□□□□□ -1.97
CCL20-202ENST00000409189 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.73□□□□□ -1.97
CCL20-202ENST00000409189 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.72□□□□□ -1.97
CCL20-202ENST00000409189 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.72□□□□□ -1.97
CCL20-202ENST00000409189 TNP1P09430 55 aa2.69□□□□□ -1.98
CCL20-202ENST00000409189 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
CCL20-202ENST00000409189 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.67□□□□□ -1.98
CCL20-202ENST00000409189 MT1XP80297 61 aa2.65□□□□□ -1.99
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.64□□□□□ -1.99
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.57□□□□□ -2
CCL20-202ENST00000409189 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.53□□□□□ -2
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.47□□□□□ -2.01
CCL20-202ENST00000409189 MT4P47944 62 aa2.46□□□□□ -2.02
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP12-3P60328 96 aa2.45□□□□□ -2.02
CCL20-202ENST00000409189 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.39□□□□□ -2.03
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.36□□□□□ -2.03
CCL20-202ENST00000409189 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
CCL20-202ENST00000409189 MT1EP04732 61 aa2.33□□□□□ -2.04
CCL20-202ENST00000409189 MUC5ACP98088 5654 aa2.3□□□□□ -2.04
CCL20-202ENST00000409189 MT1LQ93083 61 aa2.28□□□□□ -2.04
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.24□□□□□ -2.05
CCL20-202ENST00000409189 INE1O15225 51 aa2.22□□□□□ -2.05
CCL20-202ENST00000409189 MT1GP13640 62 aa2.21□□□□□ -2.06
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.19□□□□□ -2.06
CCL20-202ENST00000409189 MT1MQ8N339 61 aa2.19□□□□□ -2.06
CCL20-202ENST00000409189 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP12-4P60329 112 aa2.03□□□□□ -2.08
CCL20-202ENST00000409189 MT1AP04731 61 aa1.97□□□□□ -2.09
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa1.9□□□□□ -2.11
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.74□□□□□ -2.13
CCL20-202ENST00000409189 PHGR1C9JFL3 82 aa1.53□□□□□ -2.16
CCL20-202ENST00000409189 PRM1P04553 51 aa1.48□□□□□ -2.17
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.15□□□□□ -2.23
CCL20-202ENST00000409189 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.1□□□□□ -2.23
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