RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399892.6

SEH1L-202, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEH1L, Length 1,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-202ENST00000399892 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.35□□□□□ -1.39
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.34□□□□□ -1.39
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.34□□□□□ -1.39
SEH1L-202ENST00000399892 MT1GP13640 62 aa6.32□□□□□ -1.4
SEH1L-202ENST00000399892 MT1LQ93083 61 aa6.32□□□□□ -1.4
SEH1L-202ENST00000399892 PP632Q6XCG6 107 aa6.31□□□□□ -1.4
SEH1L-202ENST00000399892 LCE3BQ5TA77 95 aa6.23□□□□□ -1.41
SEH1L-202ENST00000399892 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SEH1L-202ENST00000399892 MT1MQ8N339 61 aa6.2□□□□□ -1.42
SEH1L-202ENST00000399892 PMAIP1Q13794 54 aa6.19□□□□□ -1.42
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.16□□□□□ -1.42
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.16□□□□□ -1.42
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.13□□□□□ -1.43
SEH1L-202ENST00000399892 PRO0628Q9UI54 55 aa6.06□□□□□ -1.44
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.04□□□□□ -1.44
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.04□□□□□ -1.44
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.04□□□□□ -1.44
SEH1L-202ENST00000399892 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-202ENST00000399892 PRAC1Q96KF2 57 aa5.82□□□□□ -1.48
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SEH1L-202ENST00000399892 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.71□□□□□ -1.5
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SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.68□□□□□ -1.5
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.63□□□□□ -1.51
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SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
SEH1L-202ENST00000399892 LCE1DQ5T752 114 aa5.59□□□□□ -1.51
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.53□□□□□ -1.52
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SEH1L-202ENST00000399892 MT1AP04731 61 aa5.39□□□□□ -1.55
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SEH1L-202ENST00000399892 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.32□□□□□ -1.56
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.32□□□□□ -1.56
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.16□□□□□ -1.58
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SEH1L-202ENST00000399892 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.11□□□□□ -1.59
SEH1L-202ENST00000399892 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.09□□□□□ -1.59
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.02□□□□□ -1.61
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5□□□□□ -1.61
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.94□□□□□ -1.62
SEH1L-202ENST00000399892 MT3P25713 68 aa4.93□□□□□ -1.62
SEH1L-202ENST00000399892 LUZP6Q538Z0 58 aa4.93□□□□□ -1.62
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.88□□□□□ -1.63
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.83□□□□□ -1.64
SEH1L-202ENST00000399892 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.78□□□□□ -1.64
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.76□□□□□ -1.65
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SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP5-8O75690 187 aa4.56□□□□□ -1.68
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.45□□□□□ -1.7
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SEH1L-202ENST00000399892 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.16□□□□□ -1.74
SEH1L-202ENST00000399892 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
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SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
SEH1L-202ENST00000399892 A0A0A0MQY5 61 aa3.68□□□□□ -1.82
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.65□□□□□ -1.82
SEH1L-202ENST00000399892 INE1O15225 51 aa3.55□□□□□ -1.84
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.48□□□□□ -1.85
SEH1L-202ENST00000399892 LCE1FQ5T754 118 aa3.47□□□□□ -1.85
SEH1L-202ENST00000399892 PRM1P04553 51 aa3.38□□□□□ -1.87
SEH1L-202ENST00000399892 H3BS24 57 aa3.24□□□□□ -1.89
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.17□□□□□ -1.9
SEH1L-202ENST00000399892 PHGR1C9JFL3 82 aa3.14□□□□□ -1.91
SEH1L-202ENST00000399892 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.89□□□□□ -1.95
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.19□□□□□ -2.06
SEH1L-202ENST00000399892 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.98□□□□□ -2.09
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