RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397023.5

PPARG-208, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, human

TSL 5

Gene PPARG, Length 2,002 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPARG-208	ENST00000397023	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPARG-208	ENST00000397023	MT1X	P80297	61 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPARG-208	ENST00000397023	MT1B	P07438	61 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PPARG-208	ENST00000397023	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.65	□□□□□ -1.82
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
PPARG-208	ENST00000397023	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PPARG-208	ENST00000397023	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PPARG-208	ENST00000397023	USH2A	O75445	5202 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PPARG-208	ENST00000397023	MT1L	Q93083	61 aa		3.27	□□□□□ -1.89
PPARG-208	ENST00000397023	MT1E	P04732	61 aa		3.24	□□□□□ -1.89
PPARG-208	ENST00000397023	KMT2D	O14686	5537 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PPARG-208	ENST00000397023	SSPO	A2VEC9	5147 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PPARG-208	ENST00000397023	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PPARG-208	ENST00000397023	MT1G	P13640	62 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PPARG-208	ENST00000397023	MT1M	Q8N339	61 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		3	□□□□□ -1.93
PPARG-208	ENST00000397023	MT3	P25713	68 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PPARG-208	ENST00000397023	MT1A	P04731	61 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PPARG-208	ENST00000397023	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
PPARG-208	ENST00000397023	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PPARG-208	ENST00000397023	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		2.88	□□□□□ -1.95
PPARG-208	ENST00000397023	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		2.86	□□□□□ -1.95
PPARG-208	ENST00000397023	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PPARG-208	ENST00000397023	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PPARG-208	ENST00000397023	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PPARG-208	ENST00000397023	PRM1	P04553	51 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PPARG-208	ENST00000397023	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PPARG-208	ENST00000397023	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PPARG-208	ENST00000397023	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PPARG-208	ENST00000397023	MDN1	Q9NU22	5596 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PPARG-208	ENST00000397023	SPRR2E	P22531	72 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PPARG-208	ENST00000397023	SPRR2B	P35325	72 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PPARG-208	ENST00000397023	SPRR2A	P35326	72 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.59	□□□□□ -2
PPARG-208	ENST00000397023	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PPARG-208	ENST00000397023	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		2.58	□□□□□ -2
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		2.49	□□□□□ -2.01
PPARG-208	ENST00000397023	SPRR2D	P22532	72 aa		2.48	□□□□□ -2.01
PPARG-208	ENST00000397023	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PPARG-208	ENST00000397023	NEB	P20929	6669 aa		2.22	□□□□□ -2.05
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		2.18	□□□□□ -2.06
PPARG-208	ENST00000397023	MT4	P47944	62 aa		2.17	□□□□□ -2.06
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		2.07	□□□□□ -2.08
PPARG-208	ENST00000397023	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.06	□□□□□ -2.08
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.01	□□□□□ -2.09
PPARG-208	ENST00000397023	MUC5AC	P98088	5654 aa		2	□□□□□ -2.09
PPARG-208	ENST00000397023	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		1.99	□□□□□ -2.09
PPARG-208	ENST00000397023	LCE1C	Q5T751	118 aa		1.9	□□□□□ -2.11
PPARG-208	ENST00000397023	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		1.9	□□□□□ -2.11
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.78	□□□□□ -2.13
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		1.78	□□□□□ -2.13
PPARG-208	ENST00000397023	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		1.74	□□□□□ -2.13
PPARG-208	ENST00000397023	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		1.66	□□□□□ -2.14
PPARG-208	ENST00000397023	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	1.62	□□□□□ -2.15
PPARG-208	ENST00000397023	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		1.52	□□□□□ -2.17
PPARG-208	ENST00000397023	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.38	□□□□□ -2.19
PPARG-208	ENST00000397023	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		0.95	□□□□□ -2.26

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.9 ms