RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRN2-201ENST00000389413 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRN2-201ENST00000389413 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRN2-201ENST00000389413 MT1MQ8N339 61 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRN2-201ENST00000389413 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRN2-201ENST00000389413 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRN2-201ENST00000389413 KMT2DO14686 5537 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRN2-201ENST00000389413 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRN2-201ENST00000389413 SPRR2DP22532 72 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRN2-201ENST00000389413 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRN2-201ENST00000389413 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRN2-201ENST00000389413 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRN2-201ENST00000389413 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRN2-201ENST00000389413 MT3P25713 68 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRN2-201ENST00000389413 MT1AP04731 61 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRN2-201ENST00000389413 PRM1P04553 51 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRN2-201ENST00000389413 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRN2-201ENST00000389413 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRN2-201ENST00000389413 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRN2-201ENST00000389413 SSPOA2VEC9 5147 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRN2-201ENST00000389413 MT4P47944 62 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRN2-201ENST00000389413 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRN2-201ENST00000389413 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRN2-201ENST00000389413 LCE1DQ5T752 114 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRN2-201ENST00000389413 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRN2-201ENST00000389413 MDN1Q9NU22 5596 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRN2-201ENST00000389413 LCE4AQ5TA78 99 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP5-9P26371 169 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRN2-201ENST00000389413 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRN2-201ENST00000389413 NEBP20929 6669 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRN2-201ENST00000389413 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRN2-201ENST00000389413 LCE1CQ5T751 118 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRN2-201ENST00000389413 LCE1EQ5T753 118 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRN2-201ENST00000389413 LCE1FQ5T754 118 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRN2-201ENST00000389413 MUC5ACP98088 5654 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRN2-201ENST00000389413 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRN2-201ENST00000389413 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP5-8O75690 187 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRN2-201ENST00000389413 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.57□□□□□ -2
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
PTPRN2-201ENST00000389413 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRN2-201ENST00000389413 PHGR1C9JFL3 82 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRN2-201ENST00000389413 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.37□□□□□ -2.19
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms