RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.53□□□□□ -1.52
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.53□□□□□ -1.52
CSAG1-202ENST00000370287 UQCR11O14957 56 aa5.51□□□□□ -1.53
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.51□□□□□ -1.53
CSAG1-202ENST00000370287 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.48□□□□□ -1.53
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.48□□□□□ -1.53
CSAG1-202ENST00000370287 TNP1P09430 55 aa5.45□□□□□ -1.54
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.45□□□□□ -1.54
CSAG1-202ENST00000370287 LCE3AQ5TA76 89 aa5.45□□□□□ -1.54
CSAG1-202ENST00000370287 A0A0A0MQY5 61 aa5.41□□□□□ -1.54
CSAG1-202ENST00000370287 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.41□□□□□ -1.54
CSAG1-202ENST00000370287 PSPHP1O15172 72 aa5.39□□□□□ -1.55
CSAG1-202ENST00000370287 Q1T7F1 81 aa5.38□□□□□ -1.55
CSAG1-202ENST00000370287 V9GYY9 64 aa5.37□□□□□ -1.55
CSAG1-202ENST00000370287 MT1LQ93083 61 aa5.34□□□□□ -1.55
CSAG1-202ENST00000370287 MT1GP13640 62 aa5.33□□□□□ -1.56
CSAG1-202ENST00000370287 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
CSAG1-202ENST00000370287 MT1MQ8N339 61 aa5.29□□□□□ -1.56
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.26□□□□□ -1.57
CSAG1-202ENST00000370287 PP632Q6XCG6 107 aa5.26□□□□□ -1.57
CSAG1-202ENST00000370287 K7ERS5 55 aa5.24□□□□□ -1.57
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP12-3P60328 96 aa5.21□□□□□ -1.58
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.2□□□□□ -1.58
CSAG1-202ENST00000370287 A6NED7 52 aa5.19□□□□□ -1.58
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.19□□□□□ -1.58
CSAG1-202ENST00000370287 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CSAG1-202ENST00000370287 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5□□□□□ -1.61
CSAG1-202ENST00000370287 MT4P47944 62 aa4.97□□□□□ -1.61
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.96□□□□□ -1.62
CSAG1-202ENST00000370287 ROMO1P60602 79 aa4.95□□□□□ -1.62
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.94□□□□□ -1.62
CSAG1-202ENST00000370287 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.93□□□□□ -1.62
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CSAG1-202ENST00000370287 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.83□□□□□ -1.64
CSAG1-202ENST00000370287 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.8□□□□□ -1.64
CSAG1-202ENST00000370287 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.73□□□□□ -1.65
CSAG1-202ENST00000370287 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.68□□□□□ -1.66
CSAG1-202ENST00000370287 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.63□□□□□ -1.67
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP12-4P60329 112 aa4.63□□□□□ -1.67
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.59□□□□□ -1.67
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.59□□□□□ -1.67
CSAG1-202ENST00000370287 BRK1Q8WUW1 75 aa4.58□□□□□ -1.68
CSAG1-202ENST00000370287 MT1AP04731 61 aa4.53□□□□□ -1.68
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.52□□□□□ -1.69
CSAG1-202ENST00000370287 PRAC1Q96KF2 57 aa4.49□□□□□ -1.69
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.37□□□□□ -1.71
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.37□□□□□ -1.71
CSAG1-202ENST00000370287 PMAIP1Q13794 54 aa4.28□□□□□ -1.72
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.28□□□□□ -1.72
CSAG1-202ENST00000370287 MT3P25713 68 aa4.12□□□□□ -1.75
CSAG1-202ENST00000370287 NDUFAF8A1L188 74 aa4.1□□□□□ -1.75
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP5-8O75690 187 aa4.1□□□□□ -1.75
CSAG1-202ENST00000370287 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.04□□□□□ -1.76
CSAG1-202ENST00000370287 PRO0628Q9UI54 55 aa4.03□□□□□ -1.76
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.91□□□□□ -1.78
CSAG1-202ENST00000370287 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
CSAG1-202ENST00000370287 MUC5ACP98088 5654 aa3.87□□□□□ -1.79
CSAG1-202ENST00000370287 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.86□□□□□ -1.79
CSAG1-202ENST00000370287 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.81□□□□□ -1.8
CSAG1-202ENST00000370287 LCE1EQ5T753 118 aa3.73□□□□□ -1.81
CSAG1-202ENST00000370287 LCE1FQ5T754 118 aa3.61□□□□□ -1.83
CSAG1-202ENST00000370287 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.55□□□□□ -1.84
CSAG1-202ENST00000370287 LCE1CQ5T751 118 aa3.48□□□□□ -1.85
CSAG1-202ENST00000370287 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.47□□□□□ -1.85
CSAG1-202ENST00000370287 LUZP6Q538Z0 58 aa3.42□□□□□ -1.86
CSAG1-202ENST00000370287 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.29□□□□□ -1.88
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.27□□□□□ -1.89
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.97□□□□□ -1.93
CSAG1-202ENST00000370287 PHGR1C9JFL3 82 aa2.72□□□□□ -1.97
CSAG1-202ENST00000370287 PRM1P04553 51 aa2.56□□□□□ -2
CSAG1-202ENST00000370287 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.49□□□□□ -2.01
CSAG1-202ENST00000370287 INE1O15225 51 aa2.25□□□□□ -2.05
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2□□□□□ -2.09
CSAG1-202ENST00000370287 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.8□□□□□ -2.12
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms