RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.59□□□□□ -1.2
PITX3-201ENST00000370002 TNP1P09430 55 aa7.58□□□□□ -1.2
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.58□□□□□ -1.2
PITX3-201ENST00000370002 MT1EP04732 61 aa7.57□□□□□ -1.2
PITX3-201ENST00000370002 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.57□□□□□ -1.2
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.54□□□□□ -1.2
PITX3-201ENST00000370002 MT1GP13640 62 aa7.4□□□□□ -1.22
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.39□□□□□ -1.23
PITX3-201ENST00000370002 PRAC1Q96KF2 57 aa7.36□□□□□ -1.23
PITX3-201ENST00000370002 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PITX3-201ENST00000370002 PP632Q6XCG6 107 aa7.35□□□□□ -1.23
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.33□□□□□ -1.24
PITX3-201ENST00000370002 MT1LQ93083 61 aa7.22□□□□□ -1.25
PITX3-201ENST00000370002 LCE3AQ5TA76 89 aa7.2□□□□□ -1.26
PITX3-201ENST00000370002 MT1MQ8N339 61 aa7.2□□□□□ -1.26
PITX3-201ENST00000370002 SVIPQ8NHG7 77 aa7.15□□□□□ -1.26
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.14□□□□□ -1.27
PITX3-201ENST00000370002 LCE4AQ5TA78 99 aa7.1□□□□□ -1.27
PITX3-201ENST00000370002 LCE1DQ5T752 114 aa7.03□□□□□ -1.28
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP12-3P60328 96 aa6.98□□□□□ -1.29
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.95□□□□□ -1.3
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.93□□□□□ -1.3
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PITX3-201ENST00000370002 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.89□□□□□ -1.31
PITX3-201ENST00000370002 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.88□□□□□ -1.31
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.81□□□□□ -1.32
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.79□□□□□ -1.32
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.77□□□□□ -1.33
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.72□□□□□ -1.33
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.57□□□□□ -1.36
PITX3-201ENST00000370002 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.57□□□□□ -1.36
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PITX3-201ENST00000370002 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.48□□□□□ -1.37
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PITX3-201ENST00000370002 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.42□□□□□ -1.38
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.35□□□□□ -1.39
PITX3-201ENST00000370002 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PITX3-201ENST00000370002 MT1AP04731 61 aa6.17□□□□□ -1.42
PITX3-201ENST00000370002 LUZP6Q538Z0 58 aa6.16□□□□□ -1.42
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.07□□□□□ -1.44
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.07□□□□□ -1.44
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.05□□□□□ -1.44
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.98□□□□□ -1.45
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.97□□□□□ -1.45
PITX3-201ENST00000370002 NDUFAF8A1L188 74 aa5.82□□□□□ -1.48
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.82□□□□□ -1.48
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP5-8O75690 187 aa5.77□□□□□ -1.49
PITX3-201ENST00000370002 MT3P25713 68 aa5.68□□□□□ -1.5
PITX3-201ENST00000370002 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.6□□□□□ -1.51
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.5□□□□□ -1.53
PITX3-201ENST00000370002 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
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PITX3-201ENST00000370002 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.44□□□□□ -1.54
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PITX3-201ENST00000370002 LCE1EQ5T753 118 aa5.28□□□□□ -1.56
PITX3-201ENST00000370002 A0A0A0MQY5 61 aa5.16□□□□□ -1.58
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PITX3-201ENST00000370002 LCE1CQ5T751 118 aa4.88□□□□□ -1.63
PITX3-201ENST00000370002 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.88□□□□□ -1.63
PITX3-201ENST00000370002 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.86□□□□□ -1.63
PITX3-201ENST00000370002 H3BS24 57 aa4.84□□□□□ -1.63
PITX3-201ENST00000370002 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.71□□□□□ -1.66
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.41□□□□□ -1.7
PITX3-201ENST00000370002 LCE1FQ5T754 118 aa4.36□□□□□ -1.71
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.36□□□□□ -1.71
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.04□□□□□ -1.76
PITX3-201ENST00000370002 PRM1P04553 51 aa4.02□□□□□ -1.77
PITX3-201ENST00000370002 PHGR1C9JFL3 82 aa3.81□□□□□ -1.8
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.6□□□□□ -1.83
PITX3-201ENST00000370002 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.43□□□□□ -1.86
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.96□□□□□ -1.94
PITX3-201ENST00000370002 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.48□□□□□ -2.01
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