RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.95□□□□□ -1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.95□□□□□ -1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.95□□□□□ -1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.88□□□□□ -1.31
KCNQ1-202ENST00000335475 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.87□□□□□ -1.31
KCNQ1-202ENST00000335475 MT1MQ8N339 61 aa6.86□□□□□ -1.31
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.86□□□□□ -1.31
KCNQ1-202ENST00000335475 MT1GP13640 62 aa6.82□□□□□ -1.32
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.78□□□□□ -1.32
KCNQ1-202ENST00000335475 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.76□□□□□ -1.33
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KCNQ1-202ENST00000335475 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.62□□□□□ -1.35
KCNQ1-202ENST00000335475 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP5-9P26371 169 aa6.4□□□□□ -1.39
KCNQ1-202ENST00000335475 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
KCNQ1-202ENST00000335475 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.33□□□□□ -1.4
KCNQ1-202ENST00000335475 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
KCNQ1-202ENST00000335475 MDN1Q9NU22 5596 aa6.3□□□□□ -1.4
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KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.16□□□□□ -1.42
KCNQ1-202ENST00000335475 SPRR2EP22531 72 aa6.16□□□□□ -1.42
KCNQ1-202ENST00000335475 SPRR2BP35325 72 aa6.16□□□□□ -1.42
KCNQ1-202ENST00000335475 SPRR2AP35326 72 aa6.16□□□□□ -1.42
KCNQ1-202ENST00000335475 LCE3BQ5TA77 95 aa6.15□□□□□ -1.43
KCNQ1-202ENST00000335475 MT1AP04731 61 aa6.14□□□□□ -1.43
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.09□□□□□ -1.43
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP12-4P60329 112 aa6□□□□□ -1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.99□□□□□ -1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.92□□□□□ -1.46
KCNQ1-202ENST00000335475 SPRR2DP22532 72 aa5.9□□□□□ -1.47
KCNQ1-202ENST00000335475 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
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KCNQ1-202ENST00000335475 MT3P25713 68 aa5.49□□□□□ -1.53
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KCNQ1-202ENST00000335475 PRM1P04553 51 aa5.3□□□□□ -1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.26□□□□□ -1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.23□□□□□ -1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 LCE4AQ5TA78 99 aa5.18□□□□□ -1.58
KCNQ1-202ENST00000335475 MT4P47944 62 aa5.16□□□□□ -1.58
KCNQ1-202ENST00000335475 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.16□□□□□ -1.58
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.14□□□□□ -1.59
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.13□□□□□ -1.59
KCNQ1-202ENST00000335475 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.96□□□□□ -1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 LCE1DQ5T752 114 aa4.95□□□□□ -1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.94□□□□□ -1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 LCE1EQ5T753 118 aa4.7□□□□□ -1.66
KCNQ1-202ENST00000335475 MUC5ACP98088 5654 aa4.62□□□□□ -1.67
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KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.4□□□□□ -1.7
KCNQ1-202ENST00000335475 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1-202ENST00000335475 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.38□□□□□ -1.71
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.37□□□□□ -1.71
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.36□□□□□ -1.71
KCNQ1-202ENST00000335475 LCE1CQ5T751 118 aa4.31□□□□□ -1.72
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.27□□□□□ -1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP5-8O75690 187 aa4.13□□□□□ -1.75
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.09□□□□□ -1.75
KCNQ1-202ENST00000335475 LCE1FQ5T754 118 aa4.03□□□□□ -1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.02□□□□□ -1.77
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.76□□□□□ -1.81
KCNQ1-202ENST00000335475 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
KCNQ1-202ENST00000335475 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.58□□□□□ -1.84
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.48□□□□□ -1.85
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.47□□□□□ -1.85
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.35□□□□□ -1.87
KCNQ1-202ENST00000335475 PHGR1C9JFL3 82 aa3.24□□□□□ -1.89
KCNQ1-202ENST00000335475 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.16□□□□□ -1.9
KCNQ1-202ENST00000335475 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.16□□□□□ -2.06
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