RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.95□□□□□ -1.46
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.93□□□□□ -1.46
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.93□□□□□ -1.46
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.93□□□□□ -1.46
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.86□□□□□ -1.47
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.84□□□□□ -1.47
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.83□□□□□ -1.48
SPNS1-202ENST00000323081 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SPNS1-202ENST00000323081 MT1MQ8N339 61 aa5.81□□□□□ -1.48
SPNS1-202ENST00000323081 MT1GP13640 62 aa5.81□□□□□ -1.48
SPNS1-202ENST00000323081 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.78□□□□□ -1.48
SPNS1-202ENST00000323081 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.77□□□□□ -1.49
SPNS1-202ENST00000323081 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.76□□□□□ -1.49
SPNS1-202ENST00000323081 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.71□□□□□ -1.5
SPNS1-202ENST00000323081 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SPNS1-202ENST00000323081 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP5-9P26371 169 aa5.51□□□□□ -1.53
SPNS1-202ENST00000323081 MDN1Q9NU22 5596 aa5.51□□□□□ -1.53
SPNS1-202ENST00000323081 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.45□□□□□ -1.54
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
SPNS1-202ENST00000323081 SPRR2EP22531 72 aa5.32□□□□□ -1.56
SPNS1-202ENST00000323081 SPRR2BP35325 72 aa5.32□□□□□ -1.56
SPNS1-202ENST00000323081 SPRR2AP35326 72 aa5.32□□□□□ -1.56
SPNS1-202ENST00000323081 LCE3BQ5TA77 95 aa5.25□□□□□ -1.57
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP12-4P60329 112 aa5.24□□□□□ -1.57
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.22□□□□□ -1.57
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.21□□□□□ -1.57
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.21□□□□□ -1.58
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SPNS1-202ENST00000323081 MT1AP04731 61 aa5.18□□□□□ -1.58
SPNS1-202ENST00000323081 SPRR2DP22532 72 aa5.11□□□□□ -1.59
SPNS1-202ENST00000323081 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.1□□□□□ -1.59
SPNS1-202ENST00000323081 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.91□□□□□ -1.62
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.9□□□□□ -1.63
SPNS1-202ENST00000323081 NEBP20929 6669 aa4.87□□□□□ -1.63
SPNS1-202ENST00000323081 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.84□□□□□ -1.63
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.72□□□□□ -1.65
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.72□□□□□ -1.65
SPNS1-202ENST00000323081 MT3P25713 68 aa4.67□□□□□ -1.66
SPNS1-202ENST00000323081 PRM1P04553 51 aa4.65□□□□□ -1.67
SPNS1-202ENST00000323081 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.55□□□□□ -1.68
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.54□□□□□ -1.68
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.53□□□□□ -1.68
SPNS1-202ENST00000323081 MT4P47944 62 aa4.5□□□□□ -1.69
SPNS1-202ENST00000323081 LCE4AQ5TA78 99 aa4.46□□□□□ -1.7
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.45□□□□□ -1.7
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.41□□□□□ -1.7
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.36□□□□□ -1.71
SPNS1-202ENST00000323081 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.35□□□□□ -1.71
SPNS1-202ENST00000323081 LCE1DQ5T752 114 aa4.31□□□□□ -1.72
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.23□□□□□ -1.73
SPNS1-202ENST00000323081 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.01□□□□□ -1.77
SPNS1-202ENST00000323081 MUC5ACP98088 5654 aa3.91□□□□□ -1.78
SPNS1-202ENST00000323081 LCE1EQ5T753 118 aa3.9□□□□□ -1.79
SPNS1-202ENST00000323081 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.8□□□□□ -1.8
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.73□□□□□ -1.81
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.73□□□□□ -1.81
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.71□□□□□ -1.82
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.7□□□□□ -1.82
SPNS1-202ENST00000323081 LCE1CQ5T751 118 aa3.67□□□□□ -1.82
SPNS1-202ENST00000323081 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.67□□□□□ -1.82
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP5-8O75690 187 aa3.57□□□□□ -1.84
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.49□□□□□ -1.85
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.4□□□□□ -1.87
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.19□□□□□ -1.9
SPNS1-202ENST00000323081 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.1□□□□□ -1.91
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.08□□□□□ -1.92
SPNS1-202ENST00000323081 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.02□□□□□ -1.93
SPNS1-202ENST00000323081 LCE1FQ5T754 118 aa3□□□□□ -1.93
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.95□□□□□ -1.94
SPNS1-202ENST00000323081 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.78□□□□□ -1.96
SPNS1-202ENST00000323081 PHGR1C9JFL3 82 aa2.75□□□□□ -1.97
SPNS1-202ENST00000323081 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.79□□□□□ -2.12
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