RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.28□□□□□ -1.08
SENP3-201ENST00000321337 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
SENP3-201ENST00000321337 MT1GP13640 62 aa8.2□□□□□ -1.1
SENP3-201ENST00000321337 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.17□□□□□ -1.1
SENP3-201ENST00000321337 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
SENP3-201ENST00000321337 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.1□□□□□ -1.11
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.02□□□□□ -1.13
SENP3-201ENST00000321337 MT1MQ8N339 61 aa7.99□□□□□ -1.13
SENP3-201ENST00000321337 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP12-4P60329 112 aa7.91□□□□□ -1.14
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.9□□□□□ -1.14
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.69□□□□□ -1.18
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SENP3-201ENST00000321337 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.6□□□□□ -1.19
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SENP3-201ENST00000321337 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SENP3-201ENST00000321337 MT1AP04731 61 aa7.28□□□□□ -1.24
SENP3-201ENST00000321337 MDN1Q9NU22 5596 aa7.24□□□□□ -1.25
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SENP3-201ENST00000321337 LCE3EQ5T5B0 92 aa7.12□□□□□ -1.27
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SENP3-201ENST00000321337 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.83□□□□□ -1.32
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SENP3-201ENST00000321337 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.74□□□□□ -1.33
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SENP3-201ENST00000321337 NEBP20929 6669 aa5.64□□□□□ -1.51
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SENP3-201ENST00000321337 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.59□□□□□ -1.51
SENP3-201ENST00000321337 LCE1EQ5T753 118 aa5.54□□□□□ -1.52
SENP3-201ENST00000321337 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.47□□□□□ -1.53
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SENP3-201ENST00000321337 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.38□□□□□ -1.55
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SENP3-201ENST00000321337 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.3□□□□□ -1.56
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SENP3-201ENST00000321337 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.26□□□□□ -1.57
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.21□□□□□ -1.58
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SENP3-201ENST00000321337 LCE1CQ5T751 118 aa4.82□□□□□ -1.64
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.74□□□□□ -1.65
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.51□□□□□ -1.69
SENP3-201ENST00000321337 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.45□□□□□ -1.7
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa4.41□□□□□ -1.7
SENP3-201ENST00000321337 LCE1FQ5T754 118 aa4.37□□□□□ -1.71
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP5-8O75690 187 aa4.33□□□□□ -1.72
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.19□□□□□ -1.74
SENP3-201ENST00000321337 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.18□□□□□ -1.74
SENP3-201ENST00000321337 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.09□□□□□ -1.75
SENP3-201ENST00000321337 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.76□□□□□ -1.81
SENP3-201ENST00000321337 PHGR1C9JFL3 82 aa3.58□□□□□ -1.84
SENP3-201ENST00000321337 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SENP3-201ENST00000321337 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.48□□□□□ -2.01
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