RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.74□□□□□ -1.81
GINS3-201ENST00000318129 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.7□□□□□ -1.82
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GINS3-201ENST00000318129 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.7□□□□□ -1.82
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP5-9P26371 169 aa3.68□□□□□ -1.82
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.68□□□□□ -1.82
GINS3-201ENST00000318129 MT1EP04732 61 aa3.67□□□□□ -1.82
GINS3-201ENST00000318129 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.67□□□□□ -1.82
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.61□□□□□ -1.83
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.6□□□□□ -1.83
GINS3-201ENST00000318129 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.59□□□□□ -1.83
GINS3-201ENST00000318129 MT1LQ93083 61 aa3.58□□□□□ -1.84
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.55□□□□□ -1.84
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.55□□□□□ -1.84
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.55□□□□□ -1.84
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.55□□□□□ -1.84
GINS3-201ENST00000318129 MT1GP13640 62 aa3.53□□□□□ -1.84
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.53□□□□□ -1.85
GINS3-201ENST00000318129 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.52□□□□□ -1.85
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GINS3-201ENST00000318129 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.49□□□□□ -1.85
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.47□□□□□ -1.85
GINS3-201ENST00000318129 MT1MQ8N339 61 aa3.45□□□□□ -1.86
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.43□□□□□ -1.86
GINS3-201ENST00000318129 SPRR2DP22532 72 aa3.4□□□□□ -1.87
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.29□□□□□ -1.88
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GINS3-201ENST00000318129 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
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GINS3-201ENST00000318129 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.2□□□□□ -1.9
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GINS3-201ENST00000318129 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.16□□□□□ -1.9
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.16□□□□□ -1.9
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.14□□□□□ -1.91
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
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GINS3-201ENST00000318129 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.08□□□□□ -1.92
GINS3-201ENST00000318129 MT1AP04731 61 aa3.05□□□□□ -1.92
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.04□□□□□ -1.92
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3□□□□□ -1.93
GINS3-201ENST00000318129 MT4P47944 62 aa2.99□□□□□ -1.93
GINS3-201ENST00000318129 LCE1DQ5T752 114 aa2.97□□□□□ -1.93
GINS3-201ENST00000318129 PRM1P04553 51 aa2.89□□□□□ -1.95
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.85□□□□□ -1.95
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.84□□□□□ -1.95
GINS3-201ENST00000318129 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.82□□□□□ -1.96
GINS3-201ENST00000318129 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.82□□□□□ -1.96
GINS3-201ENST00000318129 MT3P25713 68 aa2.79□□□□□ -1.96
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.78□□□□□ -1.96
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.77□□□□□ -1.97
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.75□□□□□ -1.97
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.75□□□□□ -1.97
GINS3-201ENST00000318129 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.72□□□□□ -1.97
GINS3-201ENST00000318129 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.61□□□□□ -1.99
GINS3-201ENST00000318129 LCE1EQ5T753 118 aa2.53□□□□□ -2
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.47□□□□□ -2.01
GINS3-201ENST00000318129 MUC5ACP98088 5654 aa2.46□□□□□ -2.01
GINS3-201ENST00000318129 LCE1FQ5T754 118 aa2.42□□□□□ -2.02
GINS3-201ENST00000318129 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP5-8O75690 187 aa2.39□□□□□ -2.03
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.38□□□□□ -2.03
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.33□□□□□ -2.04
GINS3-201ENST00000318129 LCE1CQ5T751 118 aa2.27□□□□□ -2.05
GINS3-201ENST00000318129 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.27□□□□□ -2.05
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
GINS3-201ENST00000318129 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.01□□□□□ -2.09
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.97□□□□□ -2.09
GINS3-201ENST00000318129 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.9□□□□□ -2.11
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.88□□□□□ -2.11
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.88□□□□□ -2.11
GINS3-201ENST00000318129 PHGR1C9JFL3 82 aa1.73□□□□□ -2.13
GINS3-201ENST00000318129 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.16□□□□□ -2.22
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