RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317907.8

TTC27-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC27, Length 2,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27-201ENST00000317907 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.7□□□□□ -1.82
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.67□□□□□ -1.82
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.67□□□□□ -1.82
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.67□□□□□ -1.82
TTC27-201ENST00000317907 MT1EP04732 61 aa3.66□□□□□ -1.82
TTC27-201ENST00000317907 MT1LQ93083 61 aa3.64□□□□□ -1.83
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.64□□□□□ -1.83
TTC27-201ENST00000317907 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC27-201ENST00000317907 MDN1Q9NU22 5596 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC27-201ENST00000317907 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TTC27-201ENST00000317907 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.53□□□□□ -1.85
TTC27-201ENST00000317907 MT1GP13640 62 aa3.51□□□□□ -1.85
TTC27-201ENST00000317907 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.49□□□□□ -1.85
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.47□□□□□ -1.85
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC27-201ENST00000317907 MT1MQ8N339 61 aa3.44□□□□□ -1.86
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP12-4P60329 112 aa3.42□□□□□ -1.86
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.41□□□□□ -1.86
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.38□□□□□ -1.87
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
TTC27-201ENST00000317907 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.34□□□□□ -1.87
TTC27-201ENST00000317907 LCE3BQ5TA77 95 aa3.3□□□□□ -1.88
TTC27-201ENST00000317907 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.23□□□□□ -1.89
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.22□□□□□ -1.89
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.22□□□□□ -1.89
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.22□□□□□ -1.89
TTC27-201ENST00000317907 SPRR2EP22531 72 aa3.22□□□□□ -1.89
TTC27-201ENST00000317907 SPRR2BP35325 72 aa3.22□□□□□ -1.89
TTC27-201ENST00000317907 SPRR2AP35326 72 aa3.22□□□□□ -1.89
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.22□□□□□ -1.89
TTC27-201ENST00000317907 LCE1DQ5T752 114 aa3.16□□□□□ -1.9
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP5-9P26371 169 aa3.15□□□□□ -1.9
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.15□□□□□ -1.91
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.12□□□□□ -1.91
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.1□□□□□ -1.91
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.09□□□□□ -1.91
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC27-201ENST00000317907 PRM1P04553 51 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC27-201ENST00000317907 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC27-201ENST00000317907 SPRR2DP22532 72 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC27-201ENST00000317907 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.04□□□□□ -1.92
TTC27-201ENST00000317907 MT1AP04731 61 aa3.02□□□□□ -1.93
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.97□□□□□ -1.93
TTC27-201ENST00000317907 LCE1FQ5T754 118 aa2.96□□□□□ -1.94
TTC27-201ENST00000317907 LCE1EQ5T753 118 aa2.91□□□□□ -1.94
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.91□□□□□ -1.94
TTC27-201ENST00000317907 NEBP20929 6669 aa2.9□□□□□ -1.94
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.87□□□□□ -1.95
TTC27-201ENST00000317907 MT4P47944 62 aa2.82□□□□□ -1.96
TTC27-201ENST00000317907 MT3P25713 68 aa2.73□□□□□ -1.97
TTC27-201ENST00000317907 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.71□□□□□ -1.98
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.67□□□□□ -1.98
TTC27-201ENST00000317907 LCE4AQ5TA78 99 aa2.61□□□□□ -1.99
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.59□□□□□ -1.99
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.47□□□□□ -2.01
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.46□□□□□ -2.02
TTC27-201ENST00000317907 MUC5ACP98088 5654 aa2.4□□□□□ -2.03
TTC27-201ENST00000317907 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.39□□□□□ -2.03
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
TTC27-201ENST00000317907 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
TTC27-201ENST00000317907 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.25□□□□□ -2.05
TTC27-201ENST00000317907 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.2□□□□□ -2.06
TTC27-201ENST00000317907 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.18□□□□□ -2.06
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.18□□□□□ -2.06
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.17□□□□□ -2.06
TTC27-201ENST00000317907 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.12□□□□□ -2.07
TTC27-201ENST00000317907 LCE1CQ5T751 118 aa2.09□□□□□ -2.07
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP5-8O75690 187 aa2.09□□□□□ -2.08
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.02□□□□□ -2.09
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.99□□□□□ -2.09
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.87□□□□□ -2.11
TTC27-201ENST00000317907 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.86□□□□□ -2.11
TTC27-201ENST00000317907 PHGR1C9JFL3 82 aa1.59□□□□□ -2.16
TTC27-201ENST00000317907 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.05□□□□□ -2.24
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 124 ms