RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ATG4C-201ENST00000317868 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ATG4C-201ENST00000317868 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.56□□□□□ -1.68
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ATG4C-201ENST00000317868 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.23□□□□□ -1.89
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ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP5-8O75690 187 aa2.72□□□□□ -1.97
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.68□□□□□ -1.98
ATG4C-201ENST00000317868 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
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ATG4C-201ENST00000317868 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.5□□□□□ -2.01
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.5□□□□□ -2.01
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.31□□□□□ -2.04
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.3□□□□□ -2.04
ATG4C-201ENST00000317868 PHGR1C9JFL3 82 aa2.15□□□□□ -2.07
ATG4C-201ENST00000317868 LCE1FQ5T754 118 aa2.09□□□□□ -2.08
ATG4C-201ENST00000317868 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.03□□□□□ -2.08
ATG4C-201ENST00000317868 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.48□□□□□ -2.17
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.9 ms