RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.91□□□□□ -1.94
CUX1-201ENST00000292535 MT1EP04732 61 aa2.9□□□□□ -1.95
CUX1-201ENST00000292535 PRM1P04553 51 aa2.89□□□□□ -1.95
CUX1-201ENST00000292535 LCE1DQ5T752 114 aa2.87□□□□□ -1.95
CUX1-201ENST00000292535 USH2AO75445 5202 aa2.85□□□□□ -1.95
CUX1-201ENST00000292535 MT1MQ8N339 61 aa2.85□□□□□ -1.95
CUX1-201ENST00000292535 MUC2Q02817 5179 aa2.82□□□□□ -1.96
CUX1-201ENST00000292535 MDN1Q9NU22 5596 aa2.81□□□□□ -1.96
CUX1-201ENST00000292535 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.8□□□□□ -1.96
CUX1-201ENST00000292535 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa2.8□□□□□ -1.96
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CUX1-201ENST00000292535 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.64□□□□□ -1.99
CUX1-201ENST00000292535 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.63□□□□□ -1.99
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CUX1-201ENST00000292535 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.44□□□□□ -2.02
CUX1-201ENST00000292535 SSPOA2VEC9 5147 aa2.42□□□□□ -2.02
CUX1-201ENST00000292535 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.41□□□□□ -2.02
CUX1-201ENST00000292535 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.41□□□□□ -2.02
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CUX1-201ENST00000292535 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
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CUX1-201ENST00000292535 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.21□□□□□ -2.06
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CUX1-201ENST00000292535 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
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CUX1-201ENST00000292535 KRTAP5-9P26371 169 aa2□□□□□ -2.09
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CUX1-201ENST00000292535 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa1.94□□□□□ -2.1
CUX1-201ENST00000292535 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa1.9□□□□□ -2.1
CUX1-201ENST00000292535 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
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CUX1-201ENST00000292535 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa1.63□□□□□ -2.15
CUX1-201ENST00000292535 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.58□□□□□ -2.16
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CUX1-201ENST00000292535 KRTAP5-8O75690 187 aa1.41□□□□□ -2.18
CUX1-201ENST00000292535 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.35□□□□□ -2.19
CUX1-201ENST00000292535 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.32□□□□□ -2.2
CUX1-201ENST00000292535 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.31□□□□□ -2.2
CUX1-201ENST00000292535 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.25□□□□□ -2.21
CUX1-201ENST00000292535 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.12□□□□□ -2.23
CUX1-201ENST00000292535 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.12□□□□□ -2.23
CUX1-201ENST00000292535 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.12□□□□□ -2.23
CUX1-201ENST00000292535 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
CUX1-201ENST00000292535 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa0.98□□□□□ -2.25
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