RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.21□□□□□ -1.73
PTPRO-201ENST00000281171 MT1AP04731 61 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRO-201ENST00000281171 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRO-201ENST00000281171 TNXBP22105 4242 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRO-201ENST00000281171 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRO-201ENST00000281171 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRO-201ENST00000281171 HYDINQ4G0P3 5121 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRO-201ENST00000281171 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRO-201ENST00000281171 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.03□□□□□ -1.76
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PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4□□□□□ -1.77
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4□□□□□ -1.77
PTPRO-201ENST00000281171 LPAP08519 4548 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRO-201ENST00000281171 RNF213Q63HN8 5207 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.93□□□□□ -1.78
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PTPRO-201ENST00000281171 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRO-201ENST00000281171 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRO-201ENST00000281171 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.71□□□□□ -1.82
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PTPRO-201ENST00000281171 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.54□□□□□ -1.84
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PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRO-201ENST00000281171 LCE1FQ5T754 118 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.27□□□□□ -1.89
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PTPRO-201ENST00000281171 NEBP20929 6669 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRO-201ENST00000281171 KMT2DO14686 5537 aa2.99□□□□□ -1.93
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PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.53□□□□□ -2.01
PTPRO-201ENST00000281171 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRO-201ENST00000281171 MUC5ACP98088 5654 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRO-201ENST00000281171 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP5-8O75690 187 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRO-201ENST00000281171 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
PTPRO-201ENST00000281171 PHGR1C9JFL3 82 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.01□□□□□ -2.09
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.95□□□□□ -2.1
PTPRO-201ENST00000281171 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.81□□□□□ -2.12
PTPRO-201ENST00000281171 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.26□□□□□ -2.21
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