RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270560.3

TM4SF5-201, Transcript of transmembrane 4 L six family member 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM4SF5, Length 708 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5-201ENST00000270560 A6NED7 52 aa7.56□□□□□ -1.2
TM4SF5-201ENST00000270560 LCE3BQ5TA77 95 aa7.55□□□□□ -1.2
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.47□□□□□ -1.21
TM4SF5-201ENST00000270560 MT1GP13640 62 aa7.46□□□□□ -1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 PRO0628Q9UI54 55 aa7.45□□□□□ -1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 MT1LQ93083 61 aa7.41□□□□□ -1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 PP632Q6XCG6 107 aa7.4□□□□□ -1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP12-3P60328 96 aa7.34□□□□□ -1.23
TM4SF5-201ENST00000270560 BRK1Q8WUW1 75 aa7.32□□□□□ -1.24
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TM4SF5-201ENST00000270560 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.3□□□□□ -1.24
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TM4SF5-201ENST00000270560 ROMO1P60602 79 aa7.16□□□□□ -1.26
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.1□□□□□ -1.27
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.03□□□□□ -1.28
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7□□□□□ -1.29
TM4SF5-201ENST00000270560 PMAIP1Q13794 54 aa6.96□□□□□ -1.3
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TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.93□□□□□ -1.3
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TM4SF5-201ENST00000270560 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.83□□□□□ -1.32
TM4SF5-201ENST00000270560 LCE1DQ5T752 114 aa6.82□□□□□ -1.32
TM4SF5-201ENST00000270560 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.78□□□□□ -1.32
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TM4SF5-201ENST00000270560 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.73□□□□□ -1.33
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TM4SF5-201ENST00000270560 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.65□□□□□ -1.34
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.61□□□□□ -1.35
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TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP12-4P60329 112 aa6.47□□□□□ -1.37
TM4SF5-201ENST00000270560 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.45□□□□□ -1.38
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.45□□□□□ -1.38
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.42□□□□□ -1.38
TM4SF5-201ENST00000270560 PRAC1Q96KF2 57 aa6.39□□□□□ -1.39
TM4SF5-201ENST00000270560 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.37□□□□□ -1.39
TM4SF5-201ENST00000270560 MT1AP04731 61 aa6.31□□□□□ -1.4
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.28□□□□□ -1.4
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.24□□□□□ -1.41
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.23□□□□□ -1.41
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.08□□□□□ -1.44
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.03□□□□□ -1.44
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.92□□□□□ -1.46
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.81□□□□□ -1.48
TM4SF5-201ENST00000270560 MT3P25713 68 aa5.78□□□□□ -1.48
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP5-8O75690 187 aa5.6□□□□□ -1.51
TM4SF5-201ENST00000270560 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
TM4SF5-201ENST00000270560 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.51□□□□□ -1.53
TM4SF5-201ENST00000270560 MUC5ACP98088 5654 aa5.49□□□□□ -1.53
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TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.35□□□□□ -1.55
TM4SF5-201ENST00000270560 LUZP6Q538Z0 58 aa5.34□□□□□ -1.55
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.32□□□□□ -1.56
TM4SF5-201ENST00000270560 NDUFAF8A1L188 74 aa5.31□□□□□ -1.56
TM4SF5-201ENST00000270560 H3BS24 57 aa5.3□□□□□ -1.56
TM4SF5-201ENST00000270560 LCE1EQ5T753 118 aa5.25□□□□□ -1.57
TM4SF5-201ENST00000270560 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.95□□□□□ -1.62
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.91□□□□□ -1.62
TM4SF5-201ENST00000270560 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.89□□□□□ -1.63
TM4SF5-201ENST00000270560 A0A0A0MQY5 61 aa4.87□□□□□ -1.63
TM4SF5-201ENST00000270560 LCE1CQ5T751 118 aa4.87□□□□□ -1.63
TM4SF5-201ENST00000270560 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.7□□□□□ -1.66
TM4SF5-201ENST00000270560 INE1O15225 51 aa4.55□□□□□ -1.68
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.38□□□□□ -1.71
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.33□□□□□ -1.72
TM4SF5-201ENST00000270560 LCE1FQ5T754 118 aa4.22□□□□□ -1.73
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.12□□□□□ -1.75
TM4SF5-201ENST00000270560 PHGR1C9JFL3 82 aa3.81□□□□□ -1.8
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.7□□□□□ -1.82
TM4SF5-201ENST00000270560 PRM1P04553 51 aa3.66□□□□□ -1.82
TM4SF5-201ENST00000270560 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.41□□□□□ -1.86
TM4SF5-201ENST00000270560 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.93□□□□□ -1.94
TM4SF5-201ENST00000270560 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms