RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.48□□□□□ -1.85
TTPAL-201ENST00000262605 USH2AO75445 5202 aa3.48□□□□□ -1.85
TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.46□□□□□ -1.86
TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.45□□□□□ -1.86
TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.44□□□□□ -1.86
TTPAL-201ENST00000262605 KMT2DO14686 5537 aa3.43□□□□□ -1.86
TTPAL-201ENST00000262605 LCE3BQ5TA77 95 aa3.42□□□□□ -1.86
TTPAL-201ENST00000262605 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.42□□□□□ -1.86
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TTPAL-201ENST00000262605 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.13□□□□□ -1.91
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TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.06□□□□□ -1.92
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TTPAL-201ENST00000262605 MDN1Q9NU22 5596 aa2.74□□□□□ -1.97
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TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.56□□□□□ -2
TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.4□□□□□ -2.02
TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.23□□□□□ -2.05
TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.23□□□□□ -2.05
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TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.13□□□□□ -2.07
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TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP5-8O75690 187 aa1.99□□□□□ -2.09
TTPAL-201ENST00000262605 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.91□□□□□ -2.1
TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.89□□□□□ -2.11
TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.85□□□□□ -2.11
TTPAL-201ENST00000262605 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.8□□□□□ -2.12
TTPAL-201ENST00000262605 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.76□□□□□ -2.13
TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.72□□□□□ -2.13
TTPAL-201ENST00000262605 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.68□□□□□ -2.14
TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.68□□□□□ -2.14
TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.61□□□□□ -2.15
TTPAL-201ENST00000262605 PHGR1C9JFL3 82 aa1.47□□□□□ -2.17
TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.33□□□□□ -2.2
TTPAL-201ENST00000262605 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.99□□□□□ -2.25
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