RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 MT1EP04732 61 aa7.73□□□□□ -1.17
ANKRD54-201ENST00000215941 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
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ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD54-201ENST00000215941 MT1GP13640 62 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD54-201ENST00000215941 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD54-201ENST00000215941 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD54-201ENST00000215941 MT1MQ8N339 61 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD54-201ENST00000215941 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD54-201ENST00000215941 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD54-201ENST00000215941 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
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ANKRD54-201ENST00000215941 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD54-201ENST00000215941 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP5-9P26371 169 aa6.94□□□□□ -1.3
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ANKRD54-201ENST00000215941 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 MDN1Q9NU22 5596 aa6.78□□□□□ -1.32
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ANKRD54-201ENST00000215941 SPRR2AP35326 72 aa6.75□□□□□ -1.33
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ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD54-201ENST00000215941 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.55□□□□□ -1.36
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.55□□□□□ -1.36
ANKRD54-201ENST00000215941 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.54□□□□□ -1.36
ANKRD54-201ENST00000215941 SPRR2DP22532 72 aa6.49□□□□□ -1.37
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ANKRD54-201ENST00000215941 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ANKRD54-201ENST00000215941 PRM1P04553 51 aa6.31□□□□□ -1.4
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.15□□□□□ -1.43
ANKRD54-201ENST00000215941 NEBP20929 6669 aa6.08□□□□□ -1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.05□□□□□ -1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.91□□□□□ -1.46
ANKRD54-201ENST00000215941 MT3P25713 68 aa5.9□□□□□ -1.46
ANKRD54-201ENST00000215941 LCE4AQ5TA78 99 aa5.69□□□□□ -1.5
ANKRD54-201ENST00000215941 MT4P47944 62 aa5.67□□□□□ -1.5
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.66□□□□□ -1.5
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ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.45□□□□□ -1.54
ANKRD54-201ENST00000215941 LCE1DQ5T752 114 aa5.44□□□□□ -1.54
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.44□□□□□ -1.54
ANKRD54-201ENST00000215941 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.39□□□□□ -1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.31□□□□□ -1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 LCE1EQ5T753 118 aa4.9□□□□□ -1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 MUC5ACP98088 5654 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.77□□□□□ -1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.73□□□□□ -1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.71□□□□□ -1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.6□□□□□ -1.67
ANKRD54-201ENST00000215941 LCE1CQ5T751 118 aa4.6□□□□□ -1.67
ANKRD54-201ENST00000215941 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP5-8O75690 187 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.4□□□□□ -1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.26□□□□□ -1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD54-201ENST00000215941 GPR98Q8WXG9 6306 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD54-201ENST00000215941 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.78□□□□□ -1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 LCE1FQ5T754 118 aa3.76□□□□□ -1.81
ANKRD54-201ENST00000215941 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD54-201ENST00000215941 PHGR1C9JFL3 82 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD54-201ENST00000215941 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
ANKRD54-201ENST00000215941 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.28□□□□□ -2.05
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