RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fam216aQ9DB54 251 aa15.02□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv5-9-1A0A0A6YVS4 126 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fhl2O70433 279 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ndufv3Q8BK30 104 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Borcs7Q9CRC6 105 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1810011H11RikE9PVZ2 95 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr311Q5NC59 308 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 RfxapQ8VCG9 231 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ube2tQ9CQ37 204 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cml3Q9JIY8 226 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Usp9yF8VPU6 2556 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv2-3A0A075B696 115 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm7849D3YX03 116 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc16a4Q8R0M8 500 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr975Q8VG91 310 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 SmagpQ99KC7 97 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm10842Q3U587 122 aa14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr312Q7TRZ9 308 aa14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Crlf1Q9JM58 425 aa14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Acrv1P50289 261 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vamp3P63024 103 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr317Q5NCD6 327 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr1404Q8VGE1 313 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mrpl53Q9D1H8 118 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Npc2Q9Z0J0 149 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 MtorQ9JLN9 2549 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv1-75A0A075B5Y2 117 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv9-1A0A0B4J1P3 117 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trbv17A0A140T8P8 114 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv3-8A0A075B5T0 131 aa14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rab24P35290 203 aa14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rnf152Q8BG47 203 aa14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gpr82Q8BZR0 328 aa14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hcfc2Q9D968 241 aa14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv3-3A0A0A6YWL2 116 aa14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01793 123 aa14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rab4aP56371 218 aa14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Khdc1aQ3UWR2 166 aa14.96□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rbfox3Q8BIF2 374 aa14.96□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Spink2Q8BMY7 86 aa14.96□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tmem88Q9D0N8 159 aa14.96□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm20517G3UVU6 152 aa14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 LalbaP29752 143 aa14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mrpl20Q9CQL4 149 aa14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fmc1Q9CR13 113 aa14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Chd6A3KFM7 2711 aa14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Igkv4-62A0A0G2JDW9 117 aa14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm42420A0A0J9YUQ2 99 aa14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm5218F6YH22 154 aa14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 LhbO09108 141 aa14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Shisal1Q0VBP7 198 aa14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gphb5Q812B2 130 aa14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vmn1r119E9Q4H3 307 aa14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm9767G3X930 207 aa14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mmp23O88676 391 aa14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ormdl3Q9CPZ6 153 aa14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 4930564D02RikQ9D4S4 103 aa14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fam241bQ9D882 120 aa14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv1-63A0A075B5X2 117 aa14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trav9-2A0A075B647 113 aa14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trav9-4A0A0B4J1K2 113 aa14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cacng7P62956 275 aa14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mapk1ip1lQ8BH93 242 aa14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 SbsponQ3UPR9 264 aa14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 SnrpcQ62241 159 aa14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Leprotl1Q9CQ74 131 aa14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ndufb4Q9CQC7 129 aa14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm2564F6Z9S8 108 aa14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ccl19O70460 108 aa14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CebpgP53568 150 aa14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Klk15Q8CGR4 254 aa14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trbv30A0A0B4J1P1 111 aa14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1520401A03RikA0A0J9YVH6 598 aa14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 4930447F04RikA2AFR2 126 aa14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 H2al2bA9Z055 111 aa14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fam19a2Q7TPG7 131 aa14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr1339Q8VGB1 315 aa14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nudt3Q9JI46 168 aa14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zfp462B1AWL2 2495 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm3443F7CCV5 94 aa14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 NpbQ8K4P1 119 aa14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr1367Q8VFG2 316 aa14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CubnQ9JLB4 3623 aa14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Klk1b4P00757 256 aa14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 TbpP29037 316 aa14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr761Q7TRJ0 323 aa14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tnfsf18Q7TS55 173 aa14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Avpi1Q9D7H4 142 aa14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Wfdc2Q9DAU7 174 aa14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm26938S4R185 226 aa14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1810032O08RikE9PZV8 113 aa14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm28038F7BCN9 126 aa14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01756 117 aa14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01757 117 aa14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 AY761185Q5ERI8 94 aa14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 SelenokQ9JLJ1 94 aa14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Muc4Q8JZM8 3443 aa14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Reg3gO09049 174 aa14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tex54G3UW99 86 aa14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fabp4P04117 132 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 87.6 ms