RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG18-241ENST00000602290 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG18-241ENST00000602290 HRES1P13985 223 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG18-241ENST00000602290 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.58□□□□□ -1.36
HCG18-241ENST00000602290 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.58□□□□□ -1.36
HCG18-241ENST00000602290 A0A087WSZ3 146 aa6.57□□□□□ -1.36
HCG18-241ENST00000602290 SPRR1BP22528 89 aa6.57□□□□□ -1.36
HCG18-241ENST00000602290 PRAC1Q96KF2 57 aa6.56□□□□□ -1.36
HCG18-241ENST00000602290 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.54□□□□□ -1.36
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.54□□□□□ -1.36
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.54□□□□□ -1.36
HCG18-241ENST00000602290 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.53□□□□□ -1.36
HCG18-241ENST00000602290 ZNF861PO60384 105 aa6.51□□□□□ -1.37
HCG18-241ENST00000602290 ACYP2P14621 99 aa6.51□□□□□ -1.37
HCG18-241ENST00000602290 M0R2T5 61 aa6.5□□□□□ -1.37
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.5□□□□□ -1.37
HCG18-241ENST00000602290 FAM168BA1KXE4 195 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-241ENST00000602290 PCOTHQ58A44 107 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-241ENST00000602290 LCE2BO14633 110 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-241ENST00000602290 UQCR11O14957 56 aa6.46□□□□□ -1.38
HCG18-241ENST00000602290 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.46□□□□□ -1.38
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-241ENST00000602290 XP32Q5T750 250 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-241ENST00000602290 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-241ENST00000602290 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-241ENST00000602290 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-241ENST00000602290 A0A1B0GU69 56 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-241ENST00000602290 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.42□□□□□ -1.38
HCG18-241ENST00000602290 DMAC1Q96GE9 116 aa6.42□□□□□ -1.38
HCG18-241ENST00000602290 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
HCG18-241ENST00000602290 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-241ENST00000602290 CSAG1Q6PB30 78 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-241ENST00000602290 A0A1B0GVX0 72 aa6.38□□□□□ -1.39
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.37□□□□□ -1.39
HCG18-241ENST00000602290 Q96NJ1 140 aa6.36□□□□□ -1.39
HCG18-241ENST00000602290 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.35□□□□□ -1.39
HCG18-241ENST00000602290 A0A0G2JQZ4 141 aa6.33□□□□□ -1.4
HCG18-241ENST00000602290 ROMO1P60602 79 aa6.33□□□□□ -1.4
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.31□□□□□ -1.4
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.3□□□□□ -1.4
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.3□□□□□ -1.4
HCG18-241ENST00000602290 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
HCG18-241ENST00000602290 PRLHP81277 87 aa6.27□□□□□ -1.41
HCG18-241ENST00000602290 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.26□□□□□ -1.41
HCG18-241ENST00000602290 LINC00483Q53H64 154 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.2□□□□□ -1.42
HCG18-241ENST00000602290 A8MUU9 505 aa6.19□□□□□ -1.42
HCG18-241ENST00000602290 MT2AP02795 61 aa6.18□□□□□ -1.42
HCG18-241ENST00000602290 IGKV2-30P06310 120 aa6.18□□□□□ -1.42
HCG18-241ENST00000602290 Q5W150 140 aa6.18□□□□□ -1.42
HCG18-241ENST00000602290 SPINK1P00995 79 aa6.15□□□□□ -1.42
HCG18-241ENST00000602290 MT1FP04733 61 aa6.14□□□□□ -1.43
HCG18-241ENST00000602290 KMT2DO14686 5537 aa6.13□□□□□ -1.43
HCG18-241ENST00000602290 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HCG18-241ENST00000602290 MDN1Q9NU22 5596 aa6.11□□□□□ -1.43
HCG18-241ENST00000602290 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.09□□□□□ -1.43
HCG18-241ENST00000602290 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.04□□□□□ -1.44
HCG18-241ENST00000602290 K7ERS5 55 aa6.04□□□□□ -1.44
HCG18-241ENST00000602290 P0C880 135 aa6.04□□□□□ -1.44
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.02□□□□□ -1.45
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.02□□□□□ -1.45
HCG18-241ENST00000602290 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.02□□□□□ -1.45
HCG18-241ENST00000602290 C9orf92A6NGG3 77 aa5.99□□□□□ -1.45
HCG18-241ENST00000602290 H0YAA0 97 aa5.99□□□□□ -1.45
HCG18-241ENST00000602290 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.98□□□□□ -1.45
HCG18-241ENST00000602290 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
HCG18-241ENST00000602290 A0A1B0GU33 70 aa5.95□□□□□ -1.46
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HCG18-241ENST00000602290 KRTAP5-9P26371 169 aa5.94□□□□□ -1.46
HCG18-241ENST00000602290 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.94□□□□□ -1.46
HCG18-241ENST00000602290 A0A0A0MQY5 61 aa5.93□□□□□ -1.46
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.92□□□□□ -1.46
HCG18-241ENST00000602290 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.92□□□□□ -1.46
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.87□□□□□ -1.47
HCG18-241ENST00000602290 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.85□□□□□ -1.47
HCG18-241ENST00000602290 NDUFAF8A1L188 74 aa5.78□□□□□ -1.48
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.78□□□□□ -1.48
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.78□□□□□ -1.48
HCG18-241ENST00000602290 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.73□□□□□ -1.49
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.73□□□□□ -1.49
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HCG18-241ENST00000602290 LUZP6Q538Z0 58 aa5.61□□□□□ -1.51
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.59□□□□□ -1.51
HCG18-241ENST00000602290 SPRR2EP22531 72 aa5.58□□□□□ -1.52
HCG18-241ENST00000602290 SPRR2BP35325 72 aa5.58□□□□□ -1.52
HCG18-241ENST00000602290 SPRR2AP35326 72 aa5.58□□□□□ -1.52
HCG18-241ENST00000602290 S4R3F8 94 aa5.47□□□□□ -1.53
HCG18-241ENST00000602290 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.46□□□□□ -1.54
HCG18-241ENST00000602290 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.45□□□□□ -1.54
HCG18-241ENST00000602290 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.45□□□□□ -1.54
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP10-5P60370 271 aa5.44□□□□□ -1.54
HCG18-241ENST00000602290 MT1BP07438 61 aa5.41□□□□□ -1.54
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.41□□□□□ -1.54
HCG18-241ENST00000602290 SPRR2DP22532 72 aa5.4□□□□□ -1.54
HCG18-241ENST00000602290 A0A0D9SG42 100 aa5.35□□□□□ -1.55
HCG18-241ENST00000602290 LCE3BQ5TA77 95 aa5.34□□□□□ -1.55
HCG18-241ENST00000602290 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.56
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP12-1P59990 96 aa5.33□□□□□ -1.56
HCG18-241ENST00000602290 PLAC4Q8WY50 150 aa5.33□□□□□ -1.56
HCG18-241ENST00000602290 M0QZ58 72 aa5.32□□□□□ -1.56
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