RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 NDUFB1O75438 58 aa4.13□□□□□ -1.75
SMAD3-211ENST00000559460 CXCL6P80162 114 aa4.13□□□□□ -1.75
SMAD3-211ENST00000559460 Q6ZVQ6 151 aa4.13□□□□□ -1.75
SMAD3-211ENST00000559460 PRR15Q8IV56 129 aa4.13□□□□□ -1.75
SMAD3-211ENST00000559460 CSAG1Q6PB30 78 aa4.11□□□□□ -1.75
SMAD3-211ENST00000559460 BPY2O14599 106 aa4.1□□□□□ -1.75
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.09□□□□□ -1.75
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV2-30P06310 120 aa4.09□□□□□ -1.75
SMAD3-211ENST00000559460 LCA10Q71F78 164 aa4.09□□□□□ -1.75
SMAD3-211ENST00000559460 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
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SMAD3-211ENST00000559460 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
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SMAD3-211ENST00000559460 HCG22E2RYF7 251 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD3-211ENST00000559460 H3BS24 57 aa3.99□□□□□ -1.77
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SMAD3-211ENST00000559460 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.96□□□□□ -1.78
SMAD3-211ENST00000559460 A0A087WVE0 104 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD3-211ENST00000559460 A8MUN3 132 aa3.93□□□□□ -1.78
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SMAD3-211ENST00000559460 SERP2Q8N6R1 65 aa3.89□□□□□ -1.79
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SMAD3-211ENST00000559460 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.73□□□□□ -1.81
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SMAD3-211ENST00000559460 SNURFQ9Y675 71 aa3.72□□□□□ -1.81
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SMAD3-211ENST00000559460 LINC01554Q52M75 96 aa3.68□□□□□ -1.82
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SMAD3-211ENST00000559460 MT1EP04732 61 aa3.59□□□□□ -1.83
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SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.57□□□□□ -1.84
SMAD3-211ENST00000559460 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.57□□□□□ -1.84
SMAD3-211ENST00000559460 MT1GP13640 62 aa3.56□□□□□ -1.84
SMAD3-211ENST00000559460 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD3-211ENST00000559460 COA5Q86WW8 74 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD3-211ENST00000559460 P0C880 135 aa3.53□□□□□ -1.84
SMAD3-211ENST00000559460 V9GYY9 64 aa3.49□□□□□ -1.85
SMAD3-211ENST00000559460 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.48□□□□□ -1.85
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SMAD3-211ENST00000559460 MT1MQ8N339 61 aa3.47□□□□□ -1.85
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