RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493792.1

TRAPPC12-222, Transcript of trafficking protein particle complex 12, human

TSL 2

Gene TRAPPC12, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ATOX1	O00244	68 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRAPPC12-222	ENST00000493792	C5orf47	Q569G3	176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRAPPC12-222	ENST00000493792		S4R3F8	94 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LINC00208	Q96KT6	92 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRAPPC12-222	ENST00000493792		K7ERU9	68 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MP68	P56378	58 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CSAG1	Q6PB30	78 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LCA10	Q71F78	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC12-222	ENST00000493792	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KLKP1	Q107X0	134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRAPPC12-222	ENST00000493792	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRAPPC12-222	ENST00000493792		H3BPC8	53 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRAPPC12-222	ENST00000493792		A8MUN3	132 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NDUFC1	O43677	76 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRAPPC12-222	ENST00000493792	DMAC1	Q96GE9	116 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MDN1	Q9NU22	5596 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KMT2D	O14686	5537 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TRAPPC12-222	ENST00000493792		H0YAA0	97 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRAPPC12-222	ENST00000493792		Q5VV11	94 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ACYP2	P14621	99 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRAPPC12-222	ENST00000493792	C20orf197	Q8N268	126 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MT1B	P07438	61 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRAPPC12-222	ENST00000493792		A6NN06	94 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRAPPC12-222	ENST00000493792		P0C880	135 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRAPPC12-222	ENST00000493792		R4GN34	69 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRAPPC12-222	ENST00000493792		M0QZ58	72 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRAPPC12-222	ENST00000493792	COX7C	P15954	63 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TRAPPC12-222	ENST00000493792	COA5	Q86WW8	74 aa		4.46	□□□□□ -1.7
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.46	□□□□□ -1.7
TRAPPC12-222	ENST00000493792		H7BZZ5	65 aa		4.42	□□□□□ -1.7
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.42	□□□□□ -1.7
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TRAPPC12-222	ENST00000493792	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SEC61G	P60059	68 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SPRR2E	P22531	72 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SPRR2B	P35325	72 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SPRR2A	P35326	72 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MT1X	P80297	61 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		4.32	□□□□□ -1.72
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.31	□□□□□ -1.72
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.3	□□□□□ -1.72
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.3	□□□□□ -1.72
TRAPPC12-222	ENST00000493792		A0A0D9SG42	100 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TRAPPC12-222	ENST00000493792		A0A1B0GU33	70 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TRAPPC12-222	ENST00000493792		A0A1B0GU69	56 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SPRR2D	P22532	72 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TMEM258	P61165	79 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRAPPC12-222	ENST00000493792	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRAPPC12-222	ENST00000493792		A8MU10	97 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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