RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411660.1

RPS3AP25-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 25, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP25, Length 793 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP25-201ENST00000411660 TIMM17BO60830 172 aa1.22□□□□□ -2.21
RPS3AP25-201ENST00000411660 C3orf79P0CE67 100 aa1.22□□□□□ -2.21
RPS3AP25-201ENST00000411660 TCTE3Q8IZS6 198 aa1.22□□□□□ -2.21
RPS3AP25-201ENST00000411660 PLAC4Q8WY50 150 aa1.22□□□□□ -2.21
RPS3AP25-201ENST00000411660 RAB37Q96AX2 223 aa1.22□□□□□ -2.21
RPS3AP25-201ENST00000411660 A8MUN3 132 aa1.21□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 MUSTN1Q8IVN3 82 aa1.21□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 SNHG12Q9BXW3 62 aa1.21□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 A0A1B0GV72 72 aa1.2□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 MT-ND4LP03901 98 aa1.2□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 PEA15Q15121 130 aa1.2□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 SEC11CQ9BY50 192 aa1.2□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 HSPB8Q9UJY1 196 aa1.2□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.2□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 H3BMG7 143 aa1.19□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 DPM2O94777 84 aa1.19□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 IGKCP01834 107 aa1.19□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa1.18□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa1.18□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 PLNP26678 52 aa1.18□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 RGS21Q2M5E4 152 aa1.18□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 PPDPFLQ8WWR9 84 aa1.18□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 K7EQZ3 153 aa1.17□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 LYRM7Q5U5X0 104 aa1.17□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 C7orf65Q6ZTY9 151 aa1.17□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 C2orf91Q6ZV80 131 aa1.16□□□□□ -2.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 FABP4P15090 132 aa1.15□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 PDE6GP18545 87 aa1.15□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 DSCR8Q96T75 97 aa1.14□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 H3BPC8 53 aa1.13□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 LEPROTL1O95214 131 aa1.13□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 CCKP06307 115 aa1.13□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 IFITM1P13164 125 aa1.13□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 ANKRD29Q8N6D5 301 aa1.13□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 C12orf57Q99622 126 aa1.13□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 FABP2P12104 132 aa1.12□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 TMEM254Q8TBM7 123 aa1.12□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 M0QZ58 72 aa1.11□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 TRACP01848 142 aa1.11□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa1.11□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 LINC01554Q52M75 96 aa1.11□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.1□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 LINC01545Q5VT33 79 aa1.1□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 Q6ZQT0 140 aa1.1□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 TMEM218A2RU14 115 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 S100PP25815 95 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 BATFQ16520 125 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 VPS25Q9BRG1 176 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 hDV103S1A0JD37 113 aa1.08□□□□□ -2.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 H3BT86 120 aa1.08□□□□□ -2.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 J3KT08 172 aa1.08□□□□□ -2.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 TRGC2P03986 189 aa1.08□□□□□ -2.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa1.08□□□□□ -2.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 A0A0D9SG42 100 aa1.07□□□□□ -2.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 K7EP34 96 aa1.07□□□□□ -2.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 ATOH7Q8N100 152 aa1.07□□□□□ -2.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 TMEM258P61165 79 aa1.06□□□□□ -2.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 PMAIP1Q13794 54 aa1.06□□□□□ -2.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 HCG22E2RYF7 251 aa1.05□□□□□ -2.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 NDUFB1O75438 58 aa1.05□□□□□ -2.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 C10orf95Q9H7T3 257 aa1.05□□□□□ -2.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 TRAV7A0A075B6U4 112 aa1.04□□□□□ -2.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 A0A1W2PPM0 123 aa1.04□□□□□ -2.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa1.04□□□□□ -2.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 A0A1B0GW54 56 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 S100A6P06703 90 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 COPS9Q8WXC6 57 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 A0A1B0GX51 115 aa1.02□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 H0YGX0 51 aa1.02□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 MT1AP04731 61 aa1.02□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 ORMDL1Q9P0S3 153 aa1.01□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 NDUFC1O43677 76 aa1□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 HIST1H2BOP23527 126 aa1□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 HIST1H2BBP33778 126 aa1□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 HIST1H2BDP58876 126 aa1□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 HIST1H2BCP62807 126 aa1□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 HIST2H2BEQ16778 126 aa1□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 CLLU1Q5K131 121 aa1□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 COA5Q86WW8 74 aa1□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 HIST1H2BHQ93079 126 aa1□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 HIST1H2BNQ99877 126 aa1□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 HIST1H2BMQ99879 126 aa1□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 CASC2Q6XLA1 102 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 PHGR1C9JFL3 82 aa0.98□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa0.98□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 KRTDAPP60985 99 aa0.98□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 C9JAW5 83 aa0.97□□□□□ -2.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 HIST1H2BKO60814 126 aa0.96□□□□□ -2.26
RPS3AP25-201ENST00000411660 APOC3P02656 99 aa0.96□□□□□ -2.26
RPS3AP25-201ENST00000411660 HIST1H2BJP06899 126 aa0.96□□□□□ -2.26
RPS3AP25-201ENST00000411660 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa0.95□□□□□ -2.26
RPS3AP25-201ENST00000411660 K7ERJ3 54 aa0.95□□□□□ -2.26
RPS3AP25-201ENST00000411660 FXYD2P54710 66 aa0.95□□□□□ -2.26
RPS3AP25-201ENST00000411660 NDUFA5Q16718 116 aa0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms