RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A0A1B0GX51 115 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 J3KT08 172 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NDUFB1O75438 58 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 VPS25Q9BRG1 176 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DNAL4O96015 105 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPRR2EP22531 72 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPRR2BP35325 72 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPRR2AP35326 72 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 H3BQ85 93 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IMUPQ9GZP8 106 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A0A0B4J2C4 111 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C5orf47Q569G3 176 aa6.82□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 Q6ZVQ6 151 aa6.82□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.81□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRIAP1O43715 76 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.77□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IGKV2-30P06310 120 aa6.77□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 COX8AP10176 69 aa6.77□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UBE2V1Q13404 147 aa6.77□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A6NJY4 79 aa6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 S100A2P29034 98 aa6.74□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 Q6ZQT0 140 aa6.74□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DLEU1O43261 78 aa6.73□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NDUFS5O43920 106 aa6.73□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.73□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PSMB2P49721 201 aa6.72□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C9JAW5 83 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C4orf26Q17RF5 130 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CSAG1Q6PB30 78 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HIGD1BQ9P298 99 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 COX6CP09669 75 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPRR2DP22532 72 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KLKP1Q107X0 134 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CEND1Q8N111 149 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C14orf144Q96I85 54 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRR15Q8IV56 129 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 S4R3F8 94 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 hDV103S1A0JD37 113 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FXYD2P54710 66 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A0A1B0GW54 56 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 Q5W150 140 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LCA10Q71F78 164 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPATA45Q537H7 98 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CRIPTQ9P021 101 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 K7ERJ3 54 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NREPQ16612 68 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LCE3BQ5TA77 95 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 S100A6P06703 90 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 K7EQZ3 153 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 VAMP8Q9BV40 100 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PDE6GP18545 87 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HCG22E2RYF7 251 aa6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HSD52Q0P140 79 aa6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MT1XP80297 61 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CXCL6P80162 114 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CASC2Q6XLA1 102 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KRTAP12-2P59991 146 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATXN8Q156A1 80 aa6.37□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BPY2O14599 106 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLAC4Q8WY50 150 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.36□□□□□ -1.39
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