RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ATOH7	Q8N100	152 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SKAP2-209	ENST00000497511	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		5.21	□□□□□ -1.57
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV4-1	P06312	121 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H2BK	O60814	126 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H2BO	P23527	126 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H2BB	P33778	126 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H2BD	P58876	126 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H2BC	P62807	126 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BMG7	143 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SKAP2-209	ENST00000497511	FABP2	P12104	132 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SKAP2-209	ENST00000497511	SPINK7	P58062	85 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PNM2	257 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SKAP2-209	ENST00000497511	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SKAP2-209	ENST00000497511	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H4G	Q99525	98 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GV72	72 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SKAP2-209	ENST00000497511		H0YGX0	51 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SKAP2-209	ENST00000497511	C8orf87	E5RJ46	101 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SKAP2-209	ENST00000497511	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB37	Q96AX2	223 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SKAP2-209	ENST00000497511		A6NN06	94 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAC	P01848	142 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SKAP2-209	ENST00000497511	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GVX0	72 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SKAP2-209	ENST00000497511	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CCK	P06307	115 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GX51	115 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS25	Q9BRG1	176 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SKAP2-209	ENST00000497511	MDN1	Q9NU22	5596 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAL4	O96015	105 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SKAP2-209	ENST00000497511	DSCR8	Q96T75	97 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SKAP2-209	ENST00000497511	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		5	□□□□□ -1.61
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0B4J2C4	111 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFB1	O75438	58 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SKAP2-209	ENST00000497511	S100A2	P29034	98 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SKAP2-209	ENST00000497511	KMT2D	O14686	5537 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BQ85	93 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-209	ENST00000497511		J3KT08	172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-209	ENST00000497511	COX8A	P10176	69 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-209	ENST00000497511		Q5VV11	94 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-209	ENST00000497511	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMB2	P49721	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-209	ENST00000497511	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-209	ENST00000497511	DLEU1	O43261	78 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SKAP2-209	ENST00000497511	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SKAP2-209	ENST00000497511	MT1B	P07438	61 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZVQ6	151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKAP2-209	ENST00000497511	COX6C	P09669	75 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CEND1	Q8N111	149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-209	ENST00000497511	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-209	ENST00000497511	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFS5	O43920	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-209	ENST00000497511	C5orf47	Q569G3	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-209	ENST00000497511		C9JAW5	83 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZQT0	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKAP2-209	ENST00000497511	S100A6	P06703	90 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SKAP2-209	ENST00000497511	FXYD2	P54710	66 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SKAP2-209	ENST00000497511	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SKAP2-209	ENST00000497511		K7ERJ3	54 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SPRR2E	P22531	72 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SPRR2B	P35325	72 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SPRR2A	P35326	72 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SKAP2-209	ENST00000497511	C4orf26	Q17RF5	130 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SKAP2-209	ENST00000497511	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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