RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495510.1

SPART-211, Transcript of spartin, humanhuman

TSL 2

Gene SPART, Length 2,001 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPART-211ENST00000495510 A8MWP4 228 aa6.48□□□□□ -1.37
SPART-211ENST00000495510 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SPART-211ENST00000495510 A0A1B0GVX0 72 aa6.47□□□□□ -1.37
SPART-211ENST00000495510 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.47□□□□□ -1.37
SPART-211ENST00000495510 TRACP01848 142 aa6.47□□□□□ -1.37
SPART-211ENST00000495510 TSTD3H0UI37 97 aa6.46□□□□□ -1.38
SPART-211ENST00000495510 DNAL4O96015 105 aa6.46□□□□□ -1.38
SPART-211ENST00000495510 CEND1Q8N111 149 aa6.46□□□□□ -1.38
SPART-211ENST00000495510 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SPART-211ENST00000495510 CCKP06307 115 aa6.45□□□□□ -1.38
SPART-211ENST00000495510 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.45□□□□□ -1.38
SPART-211ENST00000495510 TRIAP1O43715 76 aa6.45□□□□□ -1.38
SPART-211ENST00000495510 SPINK7P58062 85 aa6.45□□□□□ -1.38
SPART-211ENST00000495510 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.45□□□□□ -1.38
SPART-211ENST00000495510 UBE2V1Q13404 147 aa6.43□□□□□ -1.38
SPART-211ENST00000495510 J3KT08 172 aa6.43□□□□□ -1.38
SPART-211ENST00000495510 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.43□□□□□ -1.38
SPART-211ENST00000495510 SPATA45Q537H7 98 aa6.41□□□□□ -1.38
SPART-211ENST00000495510 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SPART-211ENST00000495510 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.39□□□□□ -1.39
SPART-211ENST00000495510 COX6CP09669 75 aa6.38□□□□□ -1.39
SPART-211ENST00000495510 FXYD2P54710 66 aa6.38□□□□□ -1.39
SPART-211ENST00000495510 VAMP8Q9BV40 100 aa6.38□□□□□ -1.39
SPART-211ENST00000495510 A0A1B0GV72 72 aa6.37□□□□□ -1.39
SPART-211ENST00000495510 M0R143 59 aa6.37□□□□□ -1.39
SPART-211ENST00000495510 PSMB2P49721 201 aa6.37□□□□□ -1.39
SPART-211ENST00000495510 SCGB1A1P11684 91 aa6.35□□□□□ -1.39
SPART-211ENST00000495510 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SPART-211ENST00000495510 PYY3Q5JQD4 70 aa6.35□□□□□ -1.39
SPART-211ENST00000495510 NDUFB1O75438 58 aa6.35□□□□□ -1.39
SPART-211ENST00000495510 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.35□□□□□ -1.39
SPART-211ENST00000495510 DSCR8Q96T75 97 aa6.34□□□□□ -1.39
SPART-211ENST00000495510 HSD52Q0P140 79 aa6.32□□□□□ -1.4
SPART-211ENST00000495510 VPS25Q9BRG1 176 aa6.32□□□□□ -1.4
SPART-211ENST00000495510 Q6ZQT0 140 aa6.32□□□□□ -1.4
SPART-211ENST00000495510 A0A1B0GW54 56 aa6.31□□□□□ -1.4
SPART-211ENST00000495510 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.3□□□□□ -1.4
SPART-211ENST00000495510 C9JAW5 83 aa6.29□□□□□ -1.4
SPART-211ENST00000495510 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.28□□□□□ -1.4
SPART-211ENST00000495510 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.28□□□□□ -1.4
SPART-211ENST00000495510 K7ERJ3 54 aa6.27□□□□□ -1.41
SPART-211ENST00000495510 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.26□□□□□ -1.41
SPART-211ENST00000495510 Q6ZVQ6 151 aa6.25□□□□□ -1.41
SPART-211ENST00000495510 K7ERU9 68 aa6.23□□□□□ -1.41
SPART-211ENST00000495510 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.23□□□□□ -1.41
SPART-211ENST00000495510 NEBP20929 6669 aa6.22□□□□□ -1.41
SPART-211ENST00000495510 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.22□□□□□ -1.41
SPART-211ENST00000495510 PDE6GP18545 87 aa6.21□□□□□ -1.41
SPART-211ENST00000495510 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.21□□□□□ -1.41
SPART-211ENST00000495510 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.21□□□□□ -1.42
SPART-211ENST00000495510 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.21□□□□□ -1.42
SPART-211ENST00000495510 PRR15Q8IV56 129 aa6.21□□□□□ -1.42
SPART-211ENST00000495510 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.21□□□□□ -1.42
SPART-211ENST00000495510 C5orf47Q569G3 176 aa6.2□□□□□ -1.42
SPART-211ENST00000495510 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SPART-211ENST00000495510 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.16□□□□□ -1.42
SPART-211ENST00000495510 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.16□□□□□ -1.42
SPART-211ENST00000495510 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.16□□□□□ -1.42
SPART-211ENST00000495510 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.16□□□□□ -1.42
SPART-211ENST00000495510 ATXN8Q156A1 80 aa6.13□□□□□ -1.43
SPART-211ENST00000495510 NREPQ16612 68 aa6.13□□□□□ -1.43
SPART-211ENST00000495510 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.12□□□□□ -1.43
SPART-211ENST00000495510 hDV103S1A0JD37 113 aa6.11□□□□□ -1.43
SPART-211ENST00000495510 A6NN06 94 aa6.1□□□□□ -1.43
SPART-211ENST00000495510 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.08□□□□□ -1.44
SPART-211ENST00000495510 NDUFS5O43920 106 aa6.08□□□□□ -1.44
SPART-211ENST00000495510 IGKV2-30P06310 120 aa6.08□□□□□ -1.44
SPART-211ENST00000495510 MT1BP07438 61 aa6.07□□□□□ -1.44
SPART-211ENST00000495510 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.07□□□□□ -1.44
SPART-211ENST00000495510 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.06□□□□□ -1.44
SPART-211ENST00000495510 Q5VV11 94 aa6.06□□□□□ -1.44
SPART-211ENST00000495510 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.05□□□□□ -1.44
SPART-211ENST00000495510 K7EQZ3 153 aa6.04□□□□□ -1.44
SPART-211ENST00000495510 Q5W150 140 aa6.04□□□□□ -1.44
SPART-211ENST00000495510 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.04□□□□□ -1.44
SPART-211ENST00000495510 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SPART-211ENST00000495510 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.03□□□□□ -1.44
SPART-211ENST00000495510 KRTAP10-5P60370 271 aa6.02□□□□□ -1.45
SPART-211ENST00000495510 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.01□□□□□ -1.45
SPART-211ENST00000495510 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.01□□□□□ -1.45
SPART-211ENST00000495510 KRTAP5-9P26371 169 aa6.01□□□□□ -1.45
SPART-211ENST00000495510 BATFQ16520 125 aa6.01□□□□□ -1.45
SPART-211ENST00000495510 C4orf26Q17RF5 130 aa6□□□□□ -1.45
SPART-211ENST00000495510 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.98□□□□□ -1.45
SPART-211ENST00000495510 BPY2O14599 106 aa5.98□□□□□ -1.45
SPART-211ENST00000495510 CXCL6P80162 114 aa5.98□□□□□ -1.45
SPART-211ENST00000495510 CSAG1Q6PB30 78 aa5.98□□□□□ -1.45
SPART-211ENST00000495510 SEC61GP60059 68 aa5.97□□□□□ -1.45
SPART-211ENST00000495510 CASC2Q6XLA1 102 aa5.96□□□□□ -1.45
SPART-211ENST00000495510 S4R3F8 94 aa5.96□□□□□ -1.46
SPART-211ENST00000495510 HCG22E2RYF7 251 aa5.95□□□□□ -1.46
SPART-211ENST00000495510 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SPART-211ENST00000495510 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.94□□□□□ -1.46
SPART-211ENST00000495510 J3QR89 54 aa5.93□□□□□ -1.46
SPART-211ENST00000495510 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.93□□□□□ -1.46
SPART-211ENST00000495510 H3BT86 120 aa5.92□□□□□ -1.46
SPART-211ENST00000495510 KLKP1Q107X0 134 aa5.91□□□□□ -1.46
SPART-211ENST00000495510 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.89□□□□□ -1.47
SPART-211ENST00000495510 LCA10Q71F78 164 aa5.89□□□□□ -1.47
SPART-211ENST00000495510 CRIPTQ9P021 101 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms