RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 Q6ZQT0 140 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 J3KT08 172 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 TSTD3H0UI37 97 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 BATFQ16520 125 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.47□□□□□ -1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 PDE6GP18545 87 aa8.46□□□□□ -1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.46□□□□□ -1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A1B0GW54 56 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 NDUFB1O75438 58 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM236CP0DP71 79 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 HRES1P13985 223 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.41□□□□□ -1.06
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SH3BP4-211ENST00000493436 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-211ENST00000493436 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-211ENST00000493436 C9orf118A6NHY6 69 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-211ENST00000493436 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
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SH3BP4-211ENST00000493436 TAX1BP3O14907 124 aa8.35□□□□□ -1.07
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SH3BP4-211ENST00000493436 H3BT86 120 aa8.34□□□□□ -1.07
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SH3BP4-211ENST00000493436 PRR15Q8IV56 129 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-211ENST00000493436 MTURNQ8N3F0 131 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-211ENST00000493436 Q6ZVQ6 151 aa8.32□□□□□ -1.08
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SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 K7EQZ3 153 aa8.24□□□□□ -1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 MT2AP02795 61 aa8.24□□□□□ -1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 hDV103S1A0JD37 113 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-211ENST00000493436 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.22□□□□□ -1.09
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SH3BP4-211ENST00000493436 NDUFS5O43920 106 aa8.19□□□□□ -1.1
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SH3BP4-211ENST00000493436 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.14□□□□□ -1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 Q8N9L7 120 aa8.13□□□□□ -1.11
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SH3BP4-211ENST00000493436 CASC2Q6XLA1 102 aa8.09□□□□□ -1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.09□□□□□ -1.11
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SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.93□□□□□ -1.14
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SH3BP4-211ENST00000493436 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.69□□□□□ -1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.69□□□□□ -1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.68□□□□□ -1.18
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SH3BP4-211ENST00000493436 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.67□□□□□ -1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.67□□□□□ -1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.64□□□□□ -1.19
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SH3BP4-211ENST00000493436 UQCRQO14949 82 aa7.58□□□□□ -1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.58□□□□□ -1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 H0Y9P7 68 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A087WVE0 104 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 ATOX1O00244 68 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00643Q86TS7 51 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
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