RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
PTPA-222	ENST00000445241	ACYP1	P07311	99 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPA-222	ENST00000445241	SIGMAR1	Q99720	223 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPA-222	ENST00000445241	MUC17	Q685J3	4493 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV4-1	P06312	121 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PTPA-222	ENST00000445241		Q75L30	129 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PTPA-222	ENST00000445241	MTURN	Q8N3F0	131 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PTPA-222	ENST00000445241	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PTPA-222	ENST00000445241		J3KT08	172 aa		7.86	□□□□□ -1.15
PTPA-222	ENST00000445241	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		7.85	□□□□□ -1.15
PTPA-222	ENST00000445241	PCOTH	Q58A44	107 aa		7.85	□□□□□ -1.15
PTPA-222	ENST00000445241	MUC2	Q02817	5179 aa		7.84	□□□□□ -1.15
PTPA-222	ENST00000445241	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		7.83	□□□□□ -1.16
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00313	P59037	77 aa		7.81	□□□□□ -1.16
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		7.81	□□□□□ -1.16
PTPA-222	ENST00000445241	SCGB1A1	P11684	91 aa		7.8	□□□□□ -1.16
PTPA-222	ENST00000445241		A8MUU9	505 aa		7.79	□□□□□ -1.16
PTPA-222	ENST00000445241	C8orf87	E5RJ46	101 aa		7.79	□□□□□ -1.16
PTPA-222	ENST00000445241	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		7.79	□□□□□ -1.16
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1B0GVX0	72 aa		7.78	□□□□□ -1.16
PTPA-222	ENST00000445241	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		7.78	□□□□□ -1.16
PTPA-222	ENST00000445241	DSCR10	P59022	87 aa		7.77	□□□□□ -1.17
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFB1	O75438	58 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		7.75	□□□□□ -1.17
PTPA-222	ENST00000445241	NREP	Q16612	68 aa		7.75	□□□□□ -1.17
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		7.74	□□□□□ -1.17
PTPA-222	ENST00000445241		A8MWP4	228 aa		7.73	□□□□□ -1.17
PTPA-222	ENST00000445241	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		7.71	□□□□□ -1.18
PTPA-222	ENST00000445241	IMUP	Q9GZP8	106 aa		7.7	□□□□□ -1.18
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00643	Q86TS7	51 aa		7.68	□□□□□ -1.18
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		7.67	□□□□□ -1.18
PTPA-222	ENST00000445241	PRR15	Q8IV56	129 aa		7.67	□□□□□ -1.18
PTPA-222	ENST00000445241	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		7.65	□□□□□ -1.18
PTPA-222	ENST00000445241	PCP4	P48539	62 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPA-222	ENST00000445241	BPY2	O14599	106 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PTPA-222	ENST00000445241		Q6ZVQ6	151 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PTPA-222	ENST00000445241		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
PTPA-222	ENST00000445241	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PTPA-222	ENST00000445241	UBL5	Q9BZL1	73 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PTPA-222	ENST00000445241	MT-ATP8	P03928	68 aa		7.6	□□□□□ -1.19
PTPA-222	ENST00000445241	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00846	Q9NV44	126 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PTPA-222	ENST00000445241	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PTPA-222	ENST00000445241		K7EQZ3	153 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PTPA-222	ENST00000445241	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
PTPA-222	ENST00000445241	hDV103S1	A0JD37	113 aa		7.55	□□□□□ -1.2
PTPA-222	ENST00000445241	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
PTPA-222	ENST00000445241	MT1H	P80294	61 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PTPA-222	ENST00000445241	CXCL6	P80162	114 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PTPA-222	ENST00000445241	CASC2	Q6XLA1	102 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PTPA-222	ENST00000445241		Q8N9L7	120 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PTPA-222	ENST00000445241	HRES1	P13985	223 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PTPA-222	ENST00000445241	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PTPA-222	ENST00000445241	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PTPA-222	ENST00000445241	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PTPA-222	ENST00000445241	HCG22	E2RYF7	251 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFS5	O43920	106 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PTPA-222	ENST00000445241	SPINK7	P58062	85 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PTPA-222	ENST00000445241	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PTPA-222	ENST00000445241	ATOX1	O00244	68 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PTPA-222	ENST00000445241	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPA-222	ENST00000445241	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPA-222	ENST00000445241		M0R2T5	61 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPA-222	ENST00000445241	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPA-222	ENST00000445241	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPA-222	ENST00000445241	FAM236C	P0DP71	79 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPA-222	ENST00000445241	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PTPA-222	ENST00000445241	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPA-222	ENST00000445241		Q5W150	140 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPA-222	ENST00000445241	UQCRQ	O14949	82 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPA-222	ENST00000445241	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPA-222	ENST00000445241	COX7C	P15954	63 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPA-222	ENST00000445241	SERP2	Q8N6R1	65 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV2-30	P06310	120 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPA-222	ENST00000445241		A0A087WVE0	104 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC179	H3BU77	68 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PTPA-222	ENST00000445241	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFC1	O43677	76 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PTPA-222	ENST00000445241	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		7.12	□□□□□ -1.27
PTPA-222	ENST00000445241	C4orf26	Q17RF5	130 aa		7.11	□□□□□ -1.27
PTPA-222	ENST00000445241	KLKP1	Q107X0	134 aa		7.1	□□□□□ -1.27
PTPA-222	ENST00000445241	OCR1	Q9BZK8	76 aa		7.1	□□□□□ -1.27
PTPA-222	ENST00000445241	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		7.1	□□□□□ -1.27
PTPA-222	ENST00000445241	C5orf47	Q569G3	176 aa		7.09	□□□□□ -1.27
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM258	P61165	79 aa		7.07	□□□□□ -1.28
PTPA-222	ENST00000445241		H0Y9P7	68 aa		7.05	□□□□□ -1.28
PTPA-222	ENST00000445241	MT2A	P02795	61 aa		7.05	□□□□□ -1.28
PTPA-222	ENST00000445241		H3BPC8	53 aa		7.04	□□□□□ -1.28
PTPA-222	ENST00000445241	C20orf197	Q8N268	126 aa		7.04	□□□□□ -1.28
PTPA-222	ENST00000445241	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		7.04	□□□□□ -1.28

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