RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC179H3BU77 68 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 NCR3O14931 201 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 VPREB1P12018 145 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 CXCL6P80162 114 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 SERP2Q8N6R1 65 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 DIRC1Q969H9 104 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 UBL5Q9BZL1 73 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 COX7BP24311 80 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 Q8NDZ9 215 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 DSCR8Q96T75 97 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 CLPSL2Q6UWE3 100 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 C15orf56Q8N910 161 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRK-211ENST00000429595 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 SYCNQ0VAF6 134 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 SPRR1AP35321 89 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 Q6ZQY7 126 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 ERC2-IT1O76042 136 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM258P61165 79 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 Q8NBF4 154 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 Q6ZVQ6 151 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 PKIGQ9Y2B9 76 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 NDUFC1O43677 76 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 C1orf137Q5JT78 98 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 M0R2T5 61 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 KLKP1Q107X0 134 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 TPRXLQ17RH7 258 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 Q6ZRX8 168 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-211ENST00000429595 H0Y9J4 135 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 HIGD2BQ4VC39 106 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 SPRR4Q96PI1 79 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 J3KT08 172 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 A0A087WVE0 104 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 A0A096LNI7 61 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 IGLV7-43P04211 117 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 NREPQ16612 68 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 SPRR1BP22528 89 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 MT1HP80294 61 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 Q9BRP9 147 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 BPY2O14599 106 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PNM2 257 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 H7BZZ5 65 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV4-1P06312 121 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 OCR1Q9BZK8 76 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 MUC17Q685J3 4493 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 C20orf197Q8N268 126 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 FAM236CP0DP71 79 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 C5orf47Q569G3 176 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PNN7 141 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 FAM168BA1KXE4 195 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 F8WEM9 126 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 SSPOA2VEC9 5147 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 H3BPC8 53 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 UBE2BP63146 152 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.2 ms