RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.56□□□□□ -1.52
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1W2PPM0 123 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4B-210ENST00000428861 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1B0GVX0 72 aa5.53□□□□□ -1.52
ATG4B-210ENST00000428861 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4B-210ENST00000428861 H3BT86 120 aa5.5□□□□□ -1.53
ATG4B-210ENST00000428861 PDE6GP18545 87 aa5.5□□□□□ -1.53
ATG4B-210ENST00000428861 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ATG4B-210ENST00000428861 C8orf87E5RJ46 101 aa5.49□□□□□ -1.53
ATG4B-210ENST00000428861 J3KT08 172 aa5.49□□□□□ -1.53
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ATG4B-210ENST00000428861 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.49□□□□□ -1.53
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ATG4B-210ENST00000428861 A0A1B0GW54 56 aa5.48□□□□□ -1.53
ATG4B-210ENST00000428861 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ATG4B-210ENST00000428861 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.48□□□□□ -1.53
ATG4B-210ENST00000428861 A8MWP4 228 aa5.47□□□□□ -1.53
ATG4B-210ENST00000428861 M0R2T5 61 aa5.45□□□□□ -1.54
ATG4B-210ENST00000428861 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
ATG4B-210ENST00000428861 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.45□□□□□ -1.54
ATG4B-210ENST00000428861 HRES1P13985 223 aa5.44□□□□□ -1.54
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ATG4B-210ENST00000428861 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.44□□□□□ -1.54
ATG4B-210ENST00000428861 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
ATG4B-210ENST00000428861 PRO0461Q9UI25 63 aa5.44□□□□□ -1.54
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFB1O75438 58 aa5.43□□□□□ -1.54
ATG4B-210ENST00000428861 PRR15Q8IV56 129 aa5.43□□□□□ -1.54
ATG4B-210ENST00000428861 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.43□□□□□ -1.54
ATG4B-210ENST00000428861 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
ATG4B-210ENST00000428861 K7EP34 96 aa5.41□□□□□ -1.54
ATG4B-210ENST00000428861 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.4□□□□□ -1.54
ATG4B-210ENST00000428861 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.4□□□□□ -1.54
ATG4B-210ENST00000428861 K7EQZ3 153 aa5.4□□□□□ -1.54
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZVQ6 151 aa5.39□□□□□ -1.55
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.37□□□□□ -1.55
ATG4B-210ENST00000428861 SPINK7P58062 85 aa5.36□□□□□ -1.55
ATG4B-210ENST00000428861 Q8N9L7 120 aa5.36□□□□□ -1.55
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.36□□□□□ -1.55
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ATG4B-210ENST00000428861 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
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ATG4B-210ENST00000428861 FAM236CP0DP71 79 aa5.34□□□□□ -1.55
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.34□□□□□ -1.55
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ATG4B-210ENST00000428861 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.33□□□□□ -1.56
ATG4B-210ENST00000428861 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.3□□□□□ -1.56
ATG4B-210ENST00000428861 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.3□□□□□ -1.56
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ATG4B-210ENST00000428861 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.28□□□□□ -1.56
ATG4B-210ENST00000428861 F8W1H4 67 aa5.27□□□□□ -1.57
ATG4B-210ENST00000428861 MT2AP02795 61 aa5.26□□□□□ -1.57
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ATG4B-210ENST00000428861 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.22□□□□□ -1.57
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ATG4B-210ENST00000428861 CXCL6P80162 114 aa5.18□□□□□ -1.58
ATG4B-210ENST00000428861 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.18□□□□□ -1.58
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.17□□□□□ -1.58
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ATG4B-210ENST00000428861 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.15□□□□□ -1.59
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ATG4B-210ENST00000428861 LCE2BO14633 110 aa5.14□□□□□ -1.59
ATG4B-210ENST00000428861 C4orf26Q17RF5 130 aa5.13□□□□□ -1.59
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1B0GV90 55 aa5.12□□□□□ -1.59
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.11□□□□□ -1.59
ATG4B-210ENST00000428861 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.1□□□□□ -1.59
ATG4B-210ENST00000428861 ACYP1P07311 99 aa5.1□□□□□ -1.59
ATG4B-210ENST00000428861 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4B-210ENST00000428861 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4B-210ENST00000428861 A0A087WVE0 104 aa5.03□□□□□ -1.6
ATG4B-210ENST00000428861 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
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ATG4B-210ENST00000428861 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.02□□□□□ -1.61
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.01□□□□□ -1.61
ATG4B-210ENST00000428861 C5orf47Q569G3 176 aa5□□□□□ -1.61
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ATG4B-210ENST00000428861 S4R3F8 94 aa4.98□□□□□ -1.61
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ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.96□□□□□ -1.62
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ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
ATG4B-210ENST00000428861 CSAG1Q6PB30 78 aa4.92□□□□□ -1.62
ATG4B-210ENST00000428861 OCR1Q9BZK8 76 aa4.92□□□□□ -1.62
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.91□□□□□ -1.62
ATG4B-210ENST00000428861 ATOX1O00244 68 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4B-210ENST00000428861 KLKP1Q107X0 134 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4B-210ENST00000428861 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG4B-210ENST00000428861 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00208Q96KT6 92 aa4.88□□□□□ -1.63
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