RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPRR2AP35326 72 aa7.44□□□□□ -1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1B0GX51 115 aa7.43□□□□□ -1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.41□□□□□ -1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.41□□□□□ -1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCKP06307 115 aa7.41□□□□□ -1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.4□□□□□ -1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.38□□□□□ -1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.38□□□□□ -1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIST1H4GQ99525 98 aa7.38□□□□□ -1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 J3KT08 172 aa7.37□□□□□ -1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1B0GV72 72 aa7.35□□□□□ -1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H3BQ85 93 aa7.34□□□□□ -1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFB1O75438 58 aa7.34□□□□□ -1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IMUPQ9GZP8 106 aa7.33□□□□□ -1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.32□□□□□ -1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.29□□□□□ -1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A0B4J2C4 111 aa7.28□□□□□ -1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNAL4O96015 105 aa7.28□□□□□ -1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.28□□□□□ -1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.27□□□□□ -1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.27□□□□□ -1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VPS25Q9BRG1 176 aa7.27□□□□□ -1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C5orf47Q569G3 176 aa7.25□□□□□ -1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q6ZVQ6 151 aa7.24□□□□□ -1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.23□□□□□ -1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.22□□□□□ -1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPRR2DP22532 72 aa7.2□□□□□ -1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBE2V1Q13404 147 aa7.19□□□□□ -1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.18□□□□□ -1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.17□□□□□ -1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRIAP1O43715 76 aa7.17□□□□□ -1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV2-30P06310 120 aa7.17□□□□□ -1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLKP1Q107X0 134 aa7.17□□□□□ -1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.17□□□□□ -1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CSAG1Q6PB30 78 aa7.16□□□□□ -1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q6ZQT0 140 aa7.16□□□□□ -1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COX8AP10176 69 aa7.15□□□□□ -1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.14□□□□□ -1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.13□□□□□ -1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A6NJY4 79 aa7.13□□□□□ -1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DLEU1O43261 78 aa7.13□□□□□ -1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.12□□□□□ -1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.12□□□□□ -1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C4orf26Q17RF5 130 aa7.11□□□□□ -1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 S4R3F8 94 aa7.1□□□□□ -1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C9JAW5 83 aa7.09□□□□□ -1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFS5O43920 106 aa7.09□□□□□ -1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRR15Q8IV56 129 aa7.09□□□□□ -1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIGD1BQ9P298 99 aa7.09□□□□□ -1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COX6CP09669 75 aa7.06□□□□□ -1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCE3BQ5TA77 95 aa7.06□□□□□ -1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CRIPTQ9P021 101 aa7.06□□□□□ -1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.06□□□□□ -1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.05□□□□□ -1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSMB2P49721 201 aa7.05□□□□□ -1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEND1Q8N111 149 aa7.05□□□□□ -1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.05□□□□□ -1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 S100A2P29034 98 aa7.04□□□□□ -1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.04□□□□□ -1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1B0GW54 56 aa7.03□□□□□ -1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 hDV103S1A0JD37 113 aa7.03□□□□□ -1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCA10Q71F78 164 aa7.02□□□□□ -1.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q5W150 140 aa7.01□□□□□ -1.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C14orf144Q96I85 54 aa7□□□□□ -1.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FXYD2P54710 66 aa6.97□□□□□ -1.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.96□□□□□ -1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 K7EQZ3 153 aa6.92□□□□□ -1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP12-2P59991 146 aa6.92□□□□□ -1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NREPQ16612 68 aa6.92□□□□□ -1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MT1XP80297 61 aa6.91□□□□□ -1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.91□□□□□ -1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.9□□□□□ -1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.88□□□□□ -1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.88□□□□□ -1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDE6GP18545 87 aa6.88□□□□□ -1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPATA45Q537H7 98 aa6.87□□□□□ -1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 K7ERJ3 54 aa6.86□□□□□ -1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.86□□□□□ -1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.84□□□□□ -1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.82□□□□□ -1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HCG22E2RYF7 251 aa6.82□□□□□ -1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CXCL6P80162 114 aa6.82□□□□□ -1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.82□□□□□ -1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.82□□□□□ -1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 S100A6P06703 90 aa6.8□□□□□ -1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLAC4Q8WY50 150 aa6.79□□□□□ -1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VAMP8Q9BV40 100 aa6.79□□□□□ -1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CASC2Q6XLA1 102 aa6.78□□□□□ -1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSD52Q0P140 79 aa6.77□□□□□ -1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A8MUN3 132 aa6.75□□□□□ -1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.75□□□□□ -1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BPY2O14599 106 aa6.72□□□□□ -1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.72□□□□□ -1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 S100A1P23297 94 aa6.71□□□□□ -1.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H0YAA0 97 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.1 ms