RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRTDAPP60985 99 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A1B0GVX0 72 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 NDUFA5Q16718 116 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 COPS9Q8WXC6 57 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A0A0MQY5 61 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 FABP2P12104 132 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPRR2DP22532 72 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 C8orf87E5RJ46 101 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 RBM3P98179 157 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 C5orf47Q569G3 176 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAB37Q96AX2 223 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCKP06307 115 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKRD29Q8N6D5 301 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRTAP23-1A1A580 65 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 MT1XP80297 61 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 LCE3BQ5TA77 95 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 C8orf17Q9NRJ1 99 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRACP01848 142 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 VPS25Q9BRG1 176 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGKV2-30P06310 120 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 C4orf26Q17RF5 130 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 LYRM7Q5U5X0 104 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q5W150 140 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 HIST1H4GQ99525 98 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 H0YGX0 51 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 CEND1Q8N111 149 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 IMUPQ9GZP8 106 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 KLKP1Q107X0 134 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q6ZVQ6 151 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 LCA10Q71F78 164 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A0B4J2C4 111 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A1B0GX51 115 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 K7ERJ3 54 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 FXYD2P54710 66 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 ORMDL1Q9P0S3 153 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A087WVE0 104 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 COX8AP10176 69 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q6ZQT0 140 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 C14orf144Q96I85 54 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 HIST1H2BLQ99880 126 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 S4R3F8 94 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 J3KT08 172 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 UBE2V1Q13404 147 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 HIST3H2BBQ8N257 126 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRR15Q8IV56 129 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 DSCR8Q96T75 97 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRO1854Q9UHT4 67 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 HSBP1L1C9JCN9 74 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 K7EQZ3 153 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 NDUFS5O43920 106 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 NDUFB1O75438 58 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 DNAL4O96015 105 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRTAP12-2P59991 146 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 DLEU1O43261 78 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNCGO76070 127 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 CSAG1Q6PB30 78 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 hDV103S1A0JD37 113 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 HIGD1BQ9P298 99 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 LCE1DQ5T752 114 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 PAM16Q9Y3D7 125 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 C9JAW5 83 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 PSMB2P49721 201 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q8N9L7 120 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 C1orf64Q8NEQ6 169 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPATA45Q537H7 98 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 HCG22E2RYF7 251 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 BAALC-AS2P0C853 105 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 S100A2P29034 98 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 C14orf132Q9NPU4 83 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 H3BQ85 93 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 BPY2O14599 106 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRTAP10-12P60413 245 aa2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.3 ms