RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000310252.11

TTLL3-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 1,561 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-201ENST00000310252 A0A0G2JQZ4 141 aa6.73□□□□□ -1.33
TTLL3-201ENST00000310252 NDUFC1O43677 76 aa6.73□□□□□ -1.33
TTLL3-201ENST00000310252 MYCBP2O75592 4640 aa6.73□□□□□ -1.33
TTLL3-201ENST00000310252 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.72□□□□□ -1.33
TTLL3-201ENST00000310252 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.72□□□□□ -1.33
TTLL3-201ENST00000310252 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.72□□□□□ -1.33
TTLL3-201ENST00000310252 A0A087WSZ3 146 aa6.7□□□□□ -1.34
TTLL3-201ENST00000310252 K7EQZ3 153 aa6.7□□□□□ -1.34
TTLL3-201ENST00000310252 SVIPQ8NHG7 77 aa6.69□□□□□ -1.34
TTLL3-201ENST00000310252 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.69□□□□□ -1.34
TTLL3-201ENST00000310252 A0A0U1RQV1 116 aa6.69□□□□□ -1.34
TTLL3-201ENST00000310252 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.69□□□□□ -1.34
TTLL3-201ENST00000310252 FAM236CP0DP71 79 aa6.69□□□□□ -1.34
TTLL3-201ENST00000310252 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.69□□□□□ -1.34
TTLL3-201ENST00000310252 HCG22E2RYF7 251 aa6.67□□□□□ -1.34
TTLL3-201ENST00000310252 SNURFQ9Y675 71 aa6.67□□□□□ -1.34
TTLL3-201ENST00000310252 SPINK1P00995 79 aa6.66□□□□□ -1.34
TTLL3-201ENST00000310252 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TTLL3-201ENST00000310252 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.66□□□□□ -1.34
TTLL3-201ENST00000310252 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TTLL3-201ENST00000310252 CD164Q04900 197 aa6.65□□□□□ -1.35
TTLL3-201ENST00000310252 TNXBP22105 4242 aa6.64□□□□□ -1.35
TTLL3-201ENST00000310252 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.63□□□□□ -1.35
TTLL3-201ENST00000310252 A8MWP4 228 aa6.62□□□□□ -1.35
TTLL3-201ENST00000310252 PRR15Q8IV56 129 aa6.62□□□□□ -1.35
TTLL3-201ENST00000310252 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-201ENST00000310252 LIMD2Q9BT23 127 aa6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-201ENST00000310252 C5orf47Q569G3 176 aa6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-201ENST00000310252 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.6□□□□□ -1.35
TTLL3-201ENST00000310252 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TTLL3-201ENST00000310252 Q96NJ1 140 aa6.58□□□□□ -1.36
TTLL3-201ENST00000310252 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.57□□□□□ -1.36
TTLL3-201ENST00000310252 HERC1Q15751 4861 aa6.57□□□□□ -1.36
TTLL3-201ENST00000310252 CASC2Q6XLA1 102 aa6.56□□□□□ -1.36
TTLL3-201ENST00000310252 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.56□□□□□ -1.36
TTLL3-201ENST00000310252 Q5XG85 94 aa6.55□□□□□ -1.36
TTLL3-201ENST00000310252 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.54□□□□□ -1.36
TTLL3-201ENST00000310252 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.54□□□□□ -1.36
TTLL3-201ENST00000310252 H3BPC8 53 aa6.53□□□□□ -1.36
TTLL3-201ENST00000310252 PRR4Q16378 134 aa6.53□□□□□ -1.36
TTLL3-201ENST00000310252 NDUFB1O75438 58 aa6.52□□□□□ -1.36
TTLL3-201ENST00000310252 C1orf195Q5TG92 126 aa6.51□□□□□ -1.37
TTLL3-201ENST00000310252 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.5□□□□□ -1.37
TTLL3-201ENST00000310252 MP68P56378 58 aa6.5□□□□□ -1.37
TTLL3-201ENST00000310252 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.48□□□□□ -1.37
TTLL3-201ENST00000310252 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.48□□□□□ -1.37
TTLL3-201ENST00000310252 A0A1B0GVX0 72 aa6.48□□□□□ -1.37
TTLL3-201ENST00000310252 hDV103S1A0JD37 113 aa6.48□□□□□ -1.37
TTLL3-201ENST00000310252 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TTLL3-201ENST00000310252 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.47□□□□□ -1.37
TTLL3-201ENST00000310252 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.47□□□□□ -1.37
TTLL3-201ENST00000310252 H0Y9P7 68 aa6.46□□□□□ -1.38
TTLL3-201ENST00000310252 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.46□□□□□ -1.38
TTLL3-201ENST00000310252 C4orf26Q17RF5 130 aa6.44□□□□□ -1.38
TTLL3-201ENST00000310252 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.44□□□□□ -1.38
TTLL3-201ENST00000310252 LINC00208Q96KT6 92 aa6.44□□□□□ -1.38
TTLL3-201ENST00000310252 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
TTLL3-201ENST00000310252 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.4□□□□□ -1.39
TTLL3-201ENST00000310252 C9orf92A6NGG3 77 aa6.4□□□□□ -1.39
TTLL3-201ENST00000310252 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.4□□□□□ -1.39
TTLL3-201ENST00000310252 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.39□□□□□ -1.39
TTLL3-201ENST00000310252 C8orf87E5RJ46 101 aa6.37□□□□□ -1.39
TTLL3-201ENST00000310252 TPRXLQ17RH7 258 aa6.36□□□□□ -1.39
TTLL3-201ENST00000310252 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.36□□□□□ -1.39
TTLL3-201ENST00000310252 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.35□□□□□ -1.39
TTLL3-201ENST00000310252 LINC00313P59037 77 aa6.34□□□□□ -1.39
TTLL3-201ENST00000310252 LPAP08519 4548 aa6.31□□□□□ -1.4
TTLL3-201ENST00000310252 NDUFS5O43920 106 aa6.31□□□□□ -1.4
TTLL3-201ENST00000310252 Q1T7F1 81 aa6.31□□□□□ -1.4
TTLL3-201ENST00000310252 XP32Q5T750 250 aa6.29□□□□□ -1.4
TTLL3-201ENST00000310252 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.28□□□□□ -1.4
TTLL3-201ENST00000310252 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
TTLL3-201ENST00000310252 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.27□□□□□ -1.41
TTLL3-201ENST00000310252 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.26□□□□□ -1.41
TTLL3-201ENST00000310252 Q5W150 140 aa6.25□□□□□ -1.41
TTLL3-201ENST00000310252 PRO0628Q9UI54 55 aa6.25□□□□□ -1.41
TTLL3-201ENST00000310252 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.24□□□□□ -1.41
TTLL3-201ENST00000310252 V9GYY9 64 aa6.24□□□□□ -1.41
TTLL3-201ENST00000310252 PCOTHQ58A44 107 aa6.23□□□□□ -1.41
TTLL3-201ENST00000310252 LRP2P98164 4655 aa6.21□□□□□ -1.42
TTLL3-201ENST00000310252 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
TTLL3-201ENST00000310252 COA5Q86WW8 74 aa6.21□□□□□ -1.42
TTLL3-201ENST00000310252 Q75L30 129 aa6.2□□□□□ -1.42
TTLL3-201ENST00000310252 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.2□□□□□ -1.42
TTLL3-201ENST00000310252 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
TTLL3-201ENST00000310252 A8MUU9 505 aa6.18□□□□□ -1.42
TTLL3-201ENST00000310252 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.18□□□□□ -1.42
TTLL3-201ENST00000310252 IGKV2-30P06310 120 aa6.16□□□□□ -1.42
TTLL3-201ENST00000310252 HRES1P13985 223 aa6.14□□□□□ -1.43
TTLL3-201ENST00000310252 BRK1Q8WUW1 75 aa6.14□□□□□ -1.43
TTLL3-201ENST00000310252 DMAC1Q96GE9 116 aa6.12□□□□□ -1.43
TTLL3-201ENST00000310252 A8MUN3 132 aa6.1□□□□□ -1.43
TTLL3-201ENST00000310252 PSPHP1O15172 72 aa6.1□□□□□ -1.43
TTLL3-201ENST00000310252 Q5VV11 94 aa6.1□□□□□ -1.43
TTLL3-201ENST00000310252 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.1□□□□□ -1.43
TTLL3-201ENST00000310252 ACYP2P14621 99 aa6.09□□□□□ -1.43
TTLL3-201ENST00000310252 MUC17Q685J3 4493 aa6.07□□□□□ -1.44
TTLL3-201ENST00000310252 PRR15LQ9BU68 103 aa6.06□□□□□ -1.44
TTLL3-201ENST00000310252 RNF213Q63HN8 5207 aa6.05□□□□□ -1.44
TTLL3-201ENST00000310252 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.6 ms