RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 Q6ZRX8 168 aa11.28□□□□□ -0.6
GLIS1-202ENST00000628545 PRR26Q8N8Z3 221 aa11.28□□□□□ -0.6
GLIS1-202ENST00000628545 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa11.28□□□□□ -0.6
GLIS1-202ENST00000628545 MDFIQ99750 246 aa11.28□□□□□ -0.6
GLIS1-202ENST00000628545 HTN3P15516 51 aa11.27□□□□□ -0.61
GLIS1-202ENST00000628545 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa11.27□□□□□ -0.61
GLIS1-202ENST00000628545 H3BPC8 53 aa11.27□□□□□ -0.61
GLIS1-202ENST00000628545 A0A0G2JQZ4 141 aa11.25□□□□□ -0.61
GLIS1-202ENST00000628545 A0A1W2PNN7 141 aa11.25□□□□□ -0.61
GLIS1-202ENST00000628545 SPAG11AQ6PDA7 123 aa11.25□□□□□ -0.61
GLIS1-202ENST00000628545 RPL37AP8A6NKH3 93 aa11.24□□□□□ -0.61
GLIS1-202ENST00000628545 C15orf56Q8N910 161 aa11.24□□□□□ -0.61
GLIS1-202ENST00000628545 F8P00451 2351 aa11.22□□□□□ -0.61
GLIS1-202ENST00000628545 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
GLIS1-202ENST00000628545 ADM2Q7Z4H4 148 aa11.22□□□□□ -0.61
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
GLIS1-202ENST00000628545 CASC2Q6XLA1 102 aa11.21□□□□□ -0.61
GLIS1-202ENST00000628545 INAFM1C9JVW0 142 aa11.2□□□□□ -0.62
GLIS1-202ENST00000628545 LINC00476Q8WZB0 136 aa11.2□□□□□ -0.62
GLIS1-202ENST00000628545 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa11.2□□□□□ -0.62
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
GLIS1-202ENST00000628545 DEFB135Q30KP9 77 aa11.2□□□□□ -0.62
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa11.19□□□□□ -0.62
GLIS1-202ENST00000628545 CNBPP62633 177 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
GLIS1-202ENST00000628545 Q8NAQ8 132 aa11.16□□□□□ -0.62
GLIS1-202ENST00000628545 A0A087WSZ3 146 aa11.15□□□□□ -0.62
GLIS1-202ENST00000628545 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GLIS1-202ENST00000628545 IGFL1Q6UW32 110 aa11.14□□□□□ -0.63
GLIS1-202ENST00000628545 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GLIS1-202ENST00000628545 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa11.13□□□□□ -0.63
GLIS1-202ENST00000628545 SPRR1AP35321 89 aa11.13□□□□□ -0.63
GLIS1-202ENST00000628545 FAM168BA1KXE4 195 aa11.12□□□□□ -0.63
GLIS1-202ENST00000628545 MAST4O15021 2626 aa11.1□□□□□ -0.63
GLIS1-202ENST00000628545 PCOTHQ58A44 107 aa11.08□□□□□ -0.64
GLIS1-202ENST00000628545 SPART-AS1P0CW21 52 aa11.06□□□□□ -0.64
GLIS1-202ENST00000628545 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa11.05□□□□□ -0.64
GLIS1-202ENST00000628545 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa11.04□□□□□ -0.64
GLIS1-202ENST00000628545 TENM1Q9UKZ4 2725 aa11.03□□□□□ -0.64
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa11.01□□□□□ -0.65
GLIS1-202ENST00000628545 A8MWP4 228 aa11□□□□□ -0.65
GLIS1-202ENST00000628545 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa11□□□□□ -0.65
GLIS1-202ENST00000628545 ATRQ13535 2644 aa10.99□□□□□ -0.65
GLIS1-202ENST00000628545 HRES1P13985 223 aa10.99□□□□□ -0.65
GLIS1-202ENST00000628545 RTL8CO15255 209 aa10.98□□□□□ -0.65
GLIS1-202ENST00000628545 TLX1NBP0CAT3 122 aa10.97□□□□□ -0.65
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP10-3P60369 221 aa10.97□□□□□ -0.65
GLIS1-202ENST00000628545 REG3GQ6UW15 175 aa10.95□□□□□ -0.66
GLIS1-202ENST00000628545 VWFP04275 2813 aa10.95□□□□□ -0.66
GLIS1-202ENST00000628545 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa10.95□□□□□ -0.66
GLIS1-202ENST00000628545 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa10.93□□□□□ -0.66
GLIS1-202ENST00000628545 H0Y9J4 135 aa10.93□□□□□ -0.66
GLIS1-202ENST00000628545 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
GLIS1-202ENST00000628545 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.93□□□□□ -0.66
GLIS1-202ENST00000628545 RETNLBQ9BQ08 111 aa10.91□□□□□ -0.66
GLIS1-202ENST00000628545 A0A087X002 238 aa10.91□□□□□ -0.66
GLIS1-202ENST00000628545 PRLHP81277 87 aa10.9□□□□□ -0.66
GLIS1-202ENST00000628545 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa10.9□□□□□ -0.66
GLIS1-202ENST00000628545 CSAG1Q6PB30 78 aa10.85□□□□□ -0.67
GLIS1-202ENST00000628545 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa10.85□□□□□ -0.67
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa10.84□□□□□ -0.67
GLIS1-202ENST00000628545 LINC01556Q5JQF7 62 aa10.84□□□□□ -0.67
GLIS1-202ENST00000628545 STAB1Q9NY15 2570 aa10.83□□□□□ -0.68
GLIS1-202ENST00000628545 Q6ZR54 194 aa10.83□□□□□ -0.68
GLIS1-202ENST00000628545 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa10.82□□□□□ -0.68
GLIS1-202ENST00000628545 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa10.82□□□□□ -0.68
GLIS1-202ENST00000628545 CASC10Q5T4H9 136 aa10.8□□□□□ -0.68
GLIS1-202ENST00000628545 H3BNG1 76 aa10.8□□□□□ -0.68
GLIS1-202ENST00000628545 COL6A5A8TX70 2615 aa10.8□□□□□ -0.68
GLIS1-202ENST00000628545 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa10.78□□□□□ -0.68
GLIS1-202ENST00000628545 SPATA8Q6RVD6 105 aa10.78□□□□□ -0.68
GLIS1-202ENST00000628545 TENM2Q9NT68 2774 aa10.77□□□□□ -0.68
GLIS1-202ENST00000628545 A0A096LNI7 61 aa10.76□□□□□ -0.69
GLIS1-202ENST00000628545 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
GLIS1-202ENST00000628545 C8orf17Q9NRJ1 99 aa10.7□□□□□ -0.7
GLIS1-202ENST00000628545 CMYA5Q8N3K9 4069 aa10.69□□□□□ -0.7
GLIS1-202ENST00000628545 ANK2Q01484 3957 aa10.69□□□□□ -0.7
GLIS1-202ENST00000628545 C1orf134Q5TEV5 83 aa10.69□□□□□ -0.7
GLIS1-202ENST00000628545 DNAH10OSP0CZ25 163 aa10.67□□□□□ -0.7
GLIS1-202ENST00000628545 SPRR1BP22528 89 aa10.67□□□□□ -0.7
GLIS1-202ENST00000628545 ALMS1Q8TCU4 4167 aa10.67□□□□□ -0.7
GLIS1-202ENST00000628545 Q96NJ1 140 aa10.66□□□□□ -0.7
GLIS1-202ENST00000628545 CSMD3Q7Z407 3707 aa10.65□□□□□ -0.7
GLIS1-202ENST00000628545 MIR22HGQ0VDD5 57 aa10.65□□□□□ -0.7
GLIS1-202ENST00000628545 A0A1B0GU69 56 aa10.64□□□□□ -0.71
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa10.64□□□□□ -0.71
GLIS1-202ENST00000628545 K7EIL1 84 aa10.61□□□□□ -0.71
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa10.6□□□□□ -0.71
GLIS1-202ENST00000628545 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
GLIS1-202ENST00000628545 ACYP2P14621 99 aa10.59□□□□□ -0.71
GLIS1-202ENST00000628545 UQCR11O14957 56 aa10.58□□□□□ -0.72
GLIS1-202ENST00000628545 A0A1B0GVX0 72 aa10.57□□□□□ -0.72
GLIS1-202ENST00000628545 OXLD1Q5BKU9 147 aa10.57□□□□□ -0.72
GLIS1-202ENST00000628545 ROMO1P60602 79 aa10.57□□□□□ -0.72
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF861PO60384 105 aa10.56□□□□□ -0.72
GLIS1-202ENST00000628545 NOTCH1P46531 2555 aa10.55□□□□□ -0.72
GLIS1-202ENST00000628545 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa10.53□□□□□ -0.72
GLIS1-202ENST00000628545 DNAH3Q8TD57 4116 aa10.53□□□□□ -0.72
GLIS1-202ENST00000628545 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa10.53□□□□□ -0.72
GLIS1-202ENST00000628545 DNAH1Q9P2D7 4330 aa10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms