RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599687.1

SNRNP70-208, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U1 subunit 70, human

TSL 2

Gene SNRNP70, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP70-208	ENST00000599687	C3orf79	P0CE67	100 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP70-208	ENST00000599687	NPC2	P61916	151 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP70-208	ENST00000599687	CD164	Q04900	197 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP70-208	ENST00000599687	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP70-208	ENST00000599687	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP70-208	ENST00000599687	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP70-208	ENST00000599687	TIMM17B	O60830	172 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP70-208	ENST00000599687	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP70-208	ENST00000599687	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP70-208	ENST00000599687		Q6ZRX8	168 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP70-208	ENST00000599687	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP70-208	ENST00000599687		Q9BRP9	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP70-208	ENST00000599687	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP70-208	ENST00000599687	KRTDAP	P60985	99 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP70-208	ENST00000599687	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP70-208	ENST00000599687	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP70-208	ENST00000599687	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP70-208	ENST00000599687	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP70-208	ENST00000599687	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP70-208	ENST00000599687	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP70-208	ENST00000599687	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP70-208	ENST00000599687	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP70-208	ENST00000599687	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP70-208	ENST00000599687	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP70-208	ENST00000599687	C20orf202	A1L168	122 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP70-208	ENST00000599687	NDUFS5	O43920	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP70-208	ENST00000599687	SPINK1	P00995	79 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP70-208	ENST00000599687	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP70-208	ENST00000599687	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP70-208	ENST00000599687	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP70-208	ENST00000599687	PSPHP1	O15172	72 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP70-208	ENST00000599687	MOBP	Q13875	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP70-208	ENST00000599687	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP70-208	ENST00000599687	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP70-208	ENST00000599687	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP70-208	ENST00000599687	IFITM1	P13164	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	AKR1D1	P51857	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	SPRR1B	P22528	89 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	S100A1	P23297	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	COX7B	P24311	80 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	S100A2	P29034	98 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	PSMB2	P49721	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	SLC25A20	O43772	301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687		A0A1B0GVX0	72 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP70-208	ENST00000599687	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP70-208	ENST00000599687		A0A0U1RQV1	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP70-208	ENST00000599687	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP70-208	ENST00000599687	MT3	P25713	68 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP70-208	ENST00000599687	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP70-208	ENST00000599687	C4orf26	Q17RF5	130 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP70-208	ENST00000599687	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP70-208	ENST00000599687	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP70-208	ENST00000599687	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP70-208	ENST00000599687	DSCR10	P59022	87 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP70-208	ENST00000599687	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP70-208	ENST00000599687	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP70-208	ENST00000599687	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP70-208	ENST00000599687	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP70-208	ENST00000599687	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP70-208	ENST00000599687	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP70-208	ENST00000599687	MUC2	Q02817	5179 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP70-208	ENST00000599687	COX8A	P10176	69 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNRNP70-208	ENST00000599687	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNRNP70-208	ENST00000599687		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNRNP70-208	ENST00000599687		H7C2G1	150 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNRNP70-208	ENST00000599687	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNRNP70-208	ENST00000599687	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNRNP70-208	ENST00000599687	DLEU1	O43261	78 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNRNP70-208	ENST00000599687		Q5XG85	94 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNRNP70-208	ENST00000599687	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP70-208	ENST00000599687	C8orf87	E5RJ46	101 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP70-208	ENST00000599687	C12orf57	Q99622	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP70-208	ENST00000599687		Q6ZQY7	126 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP70-208	ENST00000599687	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP70-208	ENST00000599687	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP70-208	ENST00000599687	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP70-208	ENST00000599687	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP70-208	ENST00000599687	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP70-208	ENST00000599687		F8WEM9	126 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SNRNP70-208	ENST00000599687	BPY2	O14599	106 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SNRNP70-208	ENST00000599687	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SNRNP70-208	ENST00000599687	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65

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