RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-209ENST00000591760 VAMP8Q9BV40 100 aa14.14□□□□□ -0.15
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PTPRS-209ENST00000591760 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
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PTPRS-209ENST00000591760 CFC1P0CG37 223 aa14.09□□□□□ -0.15
PTPRS-209ENST00000591760 C1orf195Q5TG92 126 aa14.09□□□□□ -0.15
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PTPRS-209ENST00000591760 HSD52Q0P140 79 aa13.84□□□□□ -0.19
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PTPRS-209ENST00000591760 Q6Q795 121 aa13.81□□□□□ -0.2
PTPRS-209ENST00000591760 LST1O00453 97 aa13.8□□□□□ -0.2
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PTPRS-209ENST00000591760 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
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PTPRS-209ENST00000591760 K7ERJ3 54 aa13.73□□□□□ -0.21
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PTPRS-209ENST00000591760 Q96NJ1 140 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRS-209ENST00000591760 A0A1B0GV72 72 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRS-209ENST00000591760 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa13.55□□□□□ -0.24
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PTPRS-209ENST00000591760 SCGB1C2P0DMR2 95 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRS-209ENST00000591760 UBE2V1Q13404 147 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRS-209ENST00000591760 COX6B2Q6YFQ2 88 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRS-209ENST00000591760 SIGMAR1Q99720 223 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRS-209ENST00000591760 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRS-209ENST00000591760 CCKP06307 115 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRS-209ENST00000591760 A8MUU9 505 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRS-209ENST00000591760 IGKV4-1P06312 121 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRS-209ENST00000591760 DSCR10P59022 87 aa13.43□□□□□ -0.26
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PTPRS-209ENST00000591760 LINC00472Q9H8W2 130 aa13.37□□□□□ -0.27
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PTPRS-209ENST00000591760 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa13.31□□□□□ -0.28
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PTPRS-209ENST00000591760 LORP23490 312 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
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PTPRS-209ENST00000591760 C9JAW5 83 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRS-209ENST00000591760 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa13.28□□□□□ -0.28
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PTPRS-209ENST00000591760 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa13.24□□□□□ -0.29
PTPRS-209ENST00000591760 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa13.23□□□□□ -0.29
PTPRS-209ENST00000591760 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRS-209ENST00000591760 A0A1B0GVX0 72 aa13.2□□□□□ -0.3
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