RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A0U1RQV1	116 aa		5.35	□□□□□ -1.55
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF815P	A8K554	130 aa		5.35	□□□□□ -1.55
KIFC3-231	ENST00000567479	MOBP	Q13875	183 aa		5.35	□□□□□ -1.55
KIFC3-231	ENST00000567479	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
KIFC3-231	ENST00000567479	LITAF	Q99732	161 aa		5.35	□□□□□ -1.55
KIFC3-231	ENST00000567479	SPANXC	Q9NY87	97 aa		5.35	□□□□□ -1.55
KIFC3-231	ENST00000567479	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		5.34	□□□□□ -1.55
KIFC3-231	ENST00000567479	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		5.33	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479	ETDB	Q3ZM63	59 aa		5.32	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479	TEN1	Q86WV5	123 aa		5.32	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		5.32	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		5.31	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		5.31	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		5.31	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479	PRO0461	Q9UI25	63 aa		5.31	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479	MUC2	Q02817	5179 aa		5.3	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479		K7ERJ3	54 aa		5.3	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479	LCE2B	O14633	110 aa		5.3	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC25A20	O43772	301 aa		5.3	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479		Q8N377	158 aa		5.3	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		5.29	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479	COX7B	P24311	80 aa		5.29	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		5.29	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479		Q6Q795	121 aa		5.29	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479	COPS9	Q8WXC6	57 aa		5.29	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479	IFITM1	P13164	125 aa		5.28	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479	C6orf99	Q4VX62	202 aa		5.28	□□□□□ -1.56
KIFC3-231	ENST00000567479	SPRR1B	P22528	89 aa		5.27	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		5.27	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		5.27	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		5.26	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479	SNCG	O76070	127 aa		5.26	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479	PSMB2	P49721	201 aa		5.26	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		5.26	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		5.26	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		5.26	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A0B4J2C4	111 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		5.24	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479	COX6C	P09669	75 aa		5.24	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479	ATXN8	Q156A1	80 aa		5.24	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		5.24	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		5.24	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		5.23	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		5.23	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479		Q1RN00	199 aa		5.23	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479	LIMD2	Q9BT23	127 aa		5.23	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479		A4D1N5	150 aa		5.22	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479		H3BT86	120 aa		5.22	□□□□□ -1.57
KIFC3-231	ENST00000567479	ACYP1	P07311	99 aa		5.21	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479	CFC1B	P0CG36	223 aa		5.21	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479	CFC1	P0CG37	223 aa		5.21	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		5.21	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479	TCL1B	O95988	128 aa		5.2	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479	MT-ATP8	P03928	68 aa		5.2	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479	CD164	Q04900	197 aa		5.2	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479	SMIM29	Q86T20	159 aa		5.2	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		5.2	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479	IMUP	Q9GZP8	106 aa		5.2	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479		H7C2G1	150 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479	XP32	Q5T750	250 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479	MUC17	Q685J3	4493 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479		C9JAW5	83 aa		5.18	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		5.16	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		5.16	□□□□□ -1.58
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A0G2JQZ4	141 aa		5.15	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479	C9orf92	A6NGG3	77 aa		5.15	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479		Q5XG85	94 aa		5.15	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00575	Q6W349	94 aa		5.15	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		5.14	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479	hADV29S1	A0JD25	119 aa		5.14	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479		F8WEM9	126 aa		5.13	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479	LCE2C	Q5TA81	110 aa		5.13	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479	C1orf195	Q5TG92	126 aa		5.13	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479		Q6ZQY7	126 aa		5.12	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		5.12	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		5.12	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479	LST1	O00453	97 aa		5.11	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479	PCOTH	Q58A44	107 aa		5.11	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00643	Q86TS7	51 aa		5.11	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIAP1	O43715	76 aa		5.1	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479		Q6JHZ5	121 aa		5.1	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		5.09	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479	UQCRQ	O14949	82 aa		5.09	□□□□□ -1.59
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAC	P01848	142 aa		5.08	□□□□□ -1.6
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1B0GX51	115 aa		5.07	□□□□□ -1.6
KIFC3-231	ENST00000567479	IGFL1	Q6UW32	110 aa		5.07	□□□□□ -1.6
KIFC3-231	ENST00000567479	CLEC2B	Q92478	149 aa		5.07	□□□□□ -1.6
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC179	H3BU77	68 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KIFC3-231	ENST00000567479	ATOX1	O00244	68 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KIFC3-231	ENST00000567479	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KIFC3-231	ENST00000567479		H0YGX0	51 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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