RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 PRYO14603 147 aa5.57□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 DNAL4O96015 105 aa5.57□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 C6orf99Q4VX62 202 aa5.57□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.57□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00167Q96N53 147 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 MTURNQ8N3F0 131 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 CLEC2BQ92478 149 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 CDIP1Q9H305 208 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00575Q6W349 94 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 COX7BP24311 80 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 hADV29S1A0JD25 119 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZRX8 168 aa5.51□□□□□ -1.53
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SMAD3-215ENST00000560424 B5MCH6 92 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD3-215ENST00000560424 ACYP1P07311 99 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD3-215ENST00000560424 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD3-215ENST00000560424 UBE2BP63146 152 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD3-215ENST00000560424 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SMAD3-215ENST00000560424 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD3-215ENST00000560424 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD3-215ENST00000560424 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD3-215ENST00000560424 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD3-215ENST00000560424 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD3-215ENST00000560424 BCE1O60756 84 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD3-215ENST00000560424 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD3-215ENST00000560424 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 CRYGAP11844 174 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZQY7 126 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 Q9BRP9 147 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 MUC17Q685J3 4493 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 TPRXLQ17RH7 258 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.43□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 PDE6GP18545 87 aa5.43□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 Q6Q795 121 aa5.43□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF861PO60384 105 aa5.42□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 MT-ATP8P03928 68 aa5.42□□□□□ -1.54
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SMAD3-215ENST00000560424 UBE2AP49459 152 aa5.41□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 PRLHP81277 87 aa5.41□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 A0A087X002 238 aa5.4□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 ERC2-IT1O76042 136 aa5.4□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 SPRR1BP22528 89 aa5.4□□□□□ -1.54
SMAD3-215ENST00000560424 Q8N377 158 aa5.39□□□□□ -1.55
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SMAD3-215ENST00000560424 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.38□□□□□ -1.55
SMAD3-215ENST00000560424 DSCR8Q96T75 97 aa5.38□□□□□ -1.55
SMAD3-215ENST00000560424 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.38□□□□□ -1.55
SMAD3-215ENST00000560424 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.38□□□□□ -1.55
SMAD3-215ENST00000560424 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.37□□□□□ -1.55
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SMAD3-215ENST00000560424 LINC00643Q86TS7 51 aa5.37□□□□□ -1.55
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00483Q53H64 154 aa5.36□□□□□ -1.55
SMAD3-215ENST00000560424 SMIM29Q86T20 159 aa5.36□□□□□ -1.55
SMAD3-215ENST00000560424 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.36□□□□□ -1.55
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.35□□□□□ -1.55
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.35□□□□□ -1.55
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.35□□□□□ -1.55
SMAD3-215ENST00000560424 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.35□□□□□ -1.55
SMAD3-215ENST00000560424 CCKP06307 115 aa5.34□□□□□ -1.55
SMAD3-215ENST00000560424 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
SMAD3-215ENST00000560424 SPRR4Q96PI1 79 aa5.34□□□□□ -1.55
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SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.33□□□□□ -1.56
SMAD3-215ENST00000560424 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.33□□□□□ -1.56
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZQT0 140 aa5.33□□□□□ -1.56
SMAD3-215ENST00000560424 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.33□□□□□ -1.56
SMAD3-215ENST00000560424 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.33□□□□□ -1.56
SMAD3-215ENST00000560424 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.33□□□□□ -1.56
SMAD3-215ENST00000560424 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.32□□□□□ -1.56
SMAD3-215ENST00000560424 UBL5Q9BZL1 73 aa5.32□□□□□ -1.56
SMAD3-215ENST00000560424 F8WEM9 126 aa5.31□□□□□ -1.56
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.31□□□□□ -1.56
SMAD3-215ENST00000560424 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.3□□□□□ -1.56
SMAD3-215ENST00000560424 Q6JHZ5 121 aa5.3□□□□□ -1.56
SMAD3-215ENST00000560424 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
SMAD3-215ENST00000560424 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.29□□□□□ -1.56
SMAD3-215ENST00000560424 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.29□□□□□ -1.56
SMAD3-215ENST00000560424 Q8NBF4 154 aa5.27□□□□□ -1.57
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.27□□□□□ -1.57
SMAD3-215ENST00000560424 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.26□□□□□ -1.57
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PNM2 257 aa5.25□□□□□ -1.57
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.25□□□□□ -1.57
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